NBDC Research ID: hum0124.v1

 

研究内容の概要

目的: ヒト上皮成長因子受容体(epidermal growth factor receptor:EGFR)遺伝子変異をもつ肺がん発がん関連遺伝子同定

方法: エクソーム解析

対象: EGFR遺伝子変異をもつ肺がん症例

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000129 NGS(Exome) 制限公開(Type I) 2018/04/06

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分子データ

JGAS00000000129

対象 EGFR遺伝子変異をもつ肺がん(ICD10:C34):3症例(1家系)
規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq 2000]
ライブラリソース 末梢血から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) SureSelect Target Enrichment System Human All Exon V2
断片化の方法 超音波断片化(Covaris)
ライブラリ構築方法 Single-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 50 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000140
総データ量 9 GB (bam [ref:hg18])
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提供者情報

研究代表者: 菊地 利明

所 属 機 関: 新潟大学大学院 医歯学総合研究科

プロジェクト/研究グループ名: 呼吸器・感染症内科学分野

URL: http://www.med.niigata-u.ac.jp/resp/welcome.html

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム(P-DIRECT) EGFR(上皮成長因子受容体)遺伝子変異陽性肺がんの遺伝子学的発がん機構の解明 15cm0106073h0005
科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 EGFR(上皮成長因子受容体)遺伝子変異陽性肺癌の分子遺伝学的発生母地の解明 24659399


 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 Exome sequencing deciphers a germline MET mutation in familial epidermal growth factor receptor-mutant lung cancer. doi: 10.1111/cas.13233 JGAD00000000140
2

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関利用データID利用期間