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| Research ID | 研究題目 | 公開日 | データの種類 | 研究方法 | 手法 |
参加者 （対象集団） | 提供者 | アクセス制限 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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JGAS00000000002 |
SCA31罹患患者のゲノム解析データ |
v1:2013/12/01 |
NGS （WGS） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
SCA31：1症例 （日本人） |
森下 真一 |
制限（Type I） |
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DRA000908 |
関節リウマチ患者及び健常人における HLA領域の塩基配列比較解析 |
v1:2013/07/01 |
NGS （Target Capture） |
HLA領域 配列決定 |
Illumina （MiSeq） |
33検体 （セルライン） |
井ノ上 逸朗 |
非制限公開 |
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JGAS00000000001 |
上皮成長因子受容体遺伝子異変を有する 肺腺癌の体細胞性遺伝子変異プロファイル 解明のための分子疫学的研究 |
v1:2014/07/11 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （GAIIx） |
肺腺癌：97症例 （日本人） |
後藤 功一 |
制限（Type I） |
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DRA001273 JGAS00000000032 DRA003791 JGAS00000000093 JGAS00000000123 |
難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究 |
v1:2014/01/27 v2:2017/02/24 v3:2017/06/19 v4:2018/02/13 |
NGS （Target Capture） |
9遺伝子領域 69遺伝子領域 89遺伝子領域 配列決定 |
Life technoligies （Ion PGM/IonProton） Illumina （HiSeq 2000） |
Usher症候群：17症例 非症候群性難聴：82症例 （日本人） |
宇佐美 真一 |
非制限公開 制限（Type I） |
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JGAS00000000004 JGAS00000000106 JGAS00000000146 |
脳腫瘍のゲノム・遺伝子解析と その臨床病理学的意義の解明 |
v1:2014/01/31 v2:2017/06/05 v3:2017/09/01 v4:2019/02/13 |
NGS （Exome、RNA-seq） メチル化アレイ |
配列決定 発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2000, HumanMethylation450 BeadChip） |
脳腫瘍：6症例＋16症例 グリオーマ（小脳：17症例、視床：14症例、大脳：8症例） グリオーマ：94症例 （日本人） |
斉藤 延人 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000005 |
ヒトTh17細胞の活性化前後の遺伝子発現 |
v1:2015/02/12 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Applied BioSystems （AB5500 GA） |
健常者：1名 （日本人） |
巌本 三壽 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000007 |
ヒルシュスプルング病および ヒルシュスプルング類縁疾患の 遺伝要因および発症機構解明に関する研究 |
v1:2018/01/29 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
ヒルシュスプルング：5症例 家族：6例 （日本人） |
松藤 凡 |
制限（Type I） |
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DRA003802 |
ヒト初期発生にかかわる細胞の DNAメチル化解析基盤研究 |
v1:2014/12/24 v2:2015/01/07 v3:2015/08/03 |
NGS （PBAT） |
メチル化シトシン同定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
11検体 （日本人） |
有馬 隆博 |
非制限公開 |
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JGAS00000000008 |
脾類上皮嚢腫関連遺伝子の探索 |
v1:2015/06/23 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
脾類上皮嚢腫：8症例 （日本人） |
松藤 凡 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000015 |
B型肝炎ウイルスのヒトゲノム内組み込み によるエピジェネティックな修飾 |
v1:2015/10/07 |
NGS （Target Capture） |
HBV組込部位 配列決定 |
Roche GS FLX Titanium |
2検体（セルライン） HBV感染肝癌：8症例 （日本人） |
山本 博幸 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000012 |
ながはま0次コホート事業 |
v1:2015/08/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常人遺伝子型 |
Illumina （Human610-Quad, HumanOmni2.5-4/2.5-8/2.5S-8, HumanExome-12, HumanCoreExome-12） |
健常者：3712名 （日本人） |
松田 文彦 |
制限（Type I） |
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日本PGxデータサイエンスコンソーシアム PGx研究のための日本人健常者2994名の SNP遺伝子型データ |
v1:2014/10/16 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina （HumanOmni2.5-8） |
健常者：2994名 （日本人） |
末松 浩嗣 |
非制限公開 |
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JGAS00000000101 JGAS00000000114 JGAS00000000140 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2014/09/30 v2:2015/12/28 （JSNP） v3:2016/01/10 v4:2016/01/27 v5:2017/05/18 v6:2017/09/08 v7:2018/04/04 v8:2018/05/01 v9:2018/08/07 v10:2018/08/13 v11:2018/10/16 v12:2018/12/10 v13:2019/01/25 |
SNP-chip NGS （WGS、Target Capture） |
ゲノムワイド 関連解析 配列決定 |
Illumina （Human610-Quad, HumanHap550v3, HumanOmniExpress-12, HumanExome, OmniExpressExome, HiSeq2500） Perlegen Sciences （high-density oligonucleotide array） Hologic Japan （Invader） |
心筋梗塞：1666症例、対照：3198名 健常者：934名（JSNP） 35疾患：各約190症例（JSNP） 食道癌：182症例（JSNP） ALS：92症例（JSNP） T2DM：9817症例、対照：6763名 T2DM：5646症例、対照：19,420名 AD：1472症例、対照：7966名 AF：8180症例、対照：28,612名 BMI：158,284名 Genotypeデータ：182,505名 POAG：3980症例、対照：18,815名 58臨床検査値：162,255名 初潮年齢データを有する女性：67,029名 閉経年齢データを有する女性：43,861名 BBJ第1コホート：1,026名 乳癌：7,104症例、対照：23,731名 2型糖尿病腎症：2,809症例、2型糖尿病対照：5,592名 T2DM：36,614症例、対照：155,150名 （日本人） |
久保 充明 |
非制限公開 制限（Type I） |
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JGAS00000000159 |
ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の 住民ゲノム参照パネルの作成 |
v1:2014/10/14 v2:2018/12/27 v3:2019/01/11 |
NGS （WGS） |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina （HiSeq 2500） |
健常者：3552名 （日本人） |
山本 雅之 |
非制限公開 |
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DRA002604 |
精巣に発現するタンパク質群の ヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析 |
v1:2016/09/30 |
NGS （RNA-seq、ChIP-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 1500） |
健常者：1名（4検体） （日本人） |
大川 恭行 |
非制限公開 |
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JGAS00000000021 |
中枢神経原発悪性リンパ腫のエクソーム解析 |
v1:2016/02/22 |
NGS （Exome、RNA-seq） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
PCNSL：41症例 （日本人） |
間野 博行 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000009 |
神経筋変性疾患の遺伝子解析研究 |
v1:2015/02/03 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
神経筋変性疾患：14症例 対照：7名 （日本人） |
辻 省次 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000011 |
消化器癌の発癌や進展に 深く関与しうる遺伝子、並びに 非コードRNAの量的・質的な異常の探索 |
v1:2015/04/01 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
消化器癌：17症例（32検体） （日本人） |
篠村 恭久 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000013 |
筋萎縮性側索硬化症の遺伝子解析研究 |
v1:2015/01/08 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
家族性ALS：11症例 （日本人） |
田中 章景 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000014 |
精神神経疾患の原因解明および 診断法・治療法の開発に関する研究 |
v1:2015/01/26 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
健常一卵性双生児：3組6名 （日本人） |
加藤 忠史 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000017 |
同種造血幹細胞移植後 ドナー由来白血病発症にかかわる 分子機構の解析 |
v1:2015/02/02 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
白血病：1症例 ドナー：1名 （日本人） |
清井 仁 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000016 |
生活習慣病、動脈硬化性疾患、ならびに 抗加齢に関する遺伝疫学研究 |
v1:2015/01/28 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
III度以上の本態性 高血圧：30症例 （日本人） |
三木 哲郎 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000023 |
造血器腫瘍における 遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/04/16 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （GAIIx, HiSeq 2000/2500） |
MDS：13症例 CMML：1症例 （日本人） |
小川 誠司 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000024 JGAS00000000040 |
侵襲性歯周炎のヒト全ゲノム解析と遺伝子多型解析 |
v1:2016/07/28 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
侵襲性歯周炎：44症例 （日本人） |
村上 伸也 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000018 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2015/06/02 v2:2018/06/05 |
SNP-chip |
HLA領域 HLAアリルおよび 領域内遺伝子型決定 |
Illumina （HumanOmniExpress BeadChip, HumanExome BeadChip, Immunochip, HumanHap550v3 Genotyping BeadChip） |
健常者：908名 （日本人） |
久保 充明 （BBJ） |
制限（Type I） |
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Stevens-Johnson症候群に対する 遺伝子多型解析 |
v1:2016/03/09 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連解析 |
Affymetrix （Axiom ASI） |
SJS：117症例 対照：691名 （日本人） |
上田 真由美 （ゲノム支援） |
非制限公開 |
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JGAS00000000022 |
婦人科臓器に発生する悪性腫瘍の 発症に関連する分子生物学的異常の検索 |
v1:2015/04/21 |
SNP-chip |
ゲノムワイド CNV解析 |
Affymetrix （Human Mapping 250K, Nsp Array） |
卵巣癌：57症例 （日本人） |
織田 克利 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000042 JGAS00000000043 JGAS00000000044 JGAS00000000045 |
磁気共鳴画像装置で得られた脳画像の臨床評価尺度データベース構築と多施設による共同運用 |
v1:2015/11/20 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
Philips （Achieva） |
統合失調症：37症例 単極うつ病：8症例 双極性障害：2症例 健常者：129名 （日本人） |
笠井 清登 |
制限（Type I） 非制限公開 |
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JGAS00000000026 JGAS00000000027 JGAS00000000028 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 （HPCシリーズ） |
v1:2016/07/22 |
NGS （WGBS ChIP-seq RNA-seq） |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
肝細胞：8種類 （日本人） |
金井 弥栄 （IHEC） |
制限（Type I） |
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DRA003516 |
ヒト唾液由来エキソソームの 機能解析に関する研究 |
v1:2015/05/01 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （GAIIx） |
健常者：1名（3検体） （日本人） |
矢ノ下 良平 |
非制限公開 |
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JGAS00000000037 |
小細胞肺癌の網羅的ゲノム解析による 新たな治療標的の探索を目指した研究 |
v1:2015/10/01 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
SCLC：51症例 （日本人） |
後藤 功一 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000036 JGAS00000000046 JGAS00000000088 |
固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/09/16 v2:2017/12/26 |
NGS （Exome、Target Capture、RNA-seq） SNP-chip メチル化アレイ |
配列決定 発現解析 ゲノムワイド関連解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500, Miseq, Infinium MethylationEPIC） Affymetrix （GeneChip Human Mapping 250k Nspl, CytoScan HD arrays） |
RMS：16症例 PPB：7症例 NB：522症例 NB細胞株：39検体 PBL：10症例 （日本人） |
滝田 順子 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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DRA003736 |
全エクソームキャプチャプラットフォーム間の 性能比較 |
v1:2015/08/01 |
NGS （Exome） |
キャプチャ方法の 性能比較 |
Illumina （HiSeq 2500） |
HapMap-JPT：2検体 （日本人） |
久保 充明 |
非制限公開 |
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JGAS00000000035 |
関節リウマチ感受性遺伝子を用いた 関節リウマチ病態の遺伝診断法の開発研究 |
v1:2015/09/24 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
RA：39症例 対照：10名（Pooled） （日本人） |
光永 滋樹 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000041 |
家族性致死性不整脈の病因解明 |
v1:2015/11/18 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
家族性致死性不整脈：11症例 （日本人） |
蒔田 直昌 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000039 |
消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に 対する獲得耐性機構の解明 |
v1:2016/12/27 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 1500） |
イマチニブ耐性消化管間質腫瘍：4症例 （日本人） |
高橋 剛 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000038 |
生殖発生に関わる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
v1:2016/09/16 |
NGS （WGS、Exome、RNA-seq、BS-seq） |
配列決定 発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
ヒト胎盤：28検体 母体血：26検体 （日本人） |
有馬 隆博 （IHEC） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000052 |
肝胆膵癌の早期発見、進行、予後予測、 治療効果予測に関わる因子の研究 |
v1:2017/01/12 |
NGS （Exome Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
原発性肝細胞癌：33症例 （日本人） |
田中 真二 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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顎口腔領域の形質（性質や特徴） に関与する遺伝子の探索 |
v1:2016/03/02 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連解析 |
Illumina （HumanOmniExpress BeadChip） |
変性顎関節症：146症例 非罹患：374名 第三大臼歯先天性欠如有：149症例 無欠如：338名 （日本人、韓国人） |
山口 徹太郎 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000051 |
アルツハイマー病総合診断体系実用化プロジェクト （J-ADNI全国臨床研究） |
v1:2016/01/29 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
MCI：234名 AD：154名 健常高齢者群：149名 （日本人） |
岩坪 威 |
制限（Type I） 非制限公開 |
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DRA004162 |
ヒトレトロウイルス感染症に関する研究 |
v1:2016/10/31 |
NGS （ChIP-seq） |
メチル化解析 |
Illumina （NextSeq 500） |
ATL細胞株：1検体 （日本人） |
佐藤 賢文 |
非制限公開 |
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JGAS00000000047 |
思春期・若年成人急性リンパ芽球性白血病におけるトランスクリプトーム解析 |
v1:2016/03/29 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
フィラデルフィア染色体陰性ALL：99症例 フィラデルフィア染色体陽性ALL：3症例 セルライン：5検体 正常血球細胞：8検体 （日本人） |
間野 博行 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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DRA004251 |
次世代シークエンサーを用いた十二指腸・ファーター乳頭部腫瘍の全遺伝子のエクソン解析 |
v1:2016/02/05 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
ファーター乳頭部癌：60症例 （日本人、米国人） |
谷内田 真一 |
非制限公開 |
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JGAS00000000053 |
B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定 |
v1:2016/09/30 |
NGS （CAGE-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2000） |
HBVキャリア：8症例 （日本人） |
松浦 知和 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000062 |
悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定 |
v1:2016/07/20 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
悪性中皮腫患者：38症例 （日本人） |
中野 孝司 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000059 |
非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析 |
v1:2017/02/20 |
NGS （RNA-seq） メチル化アレイ |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2500, Human Methylation 450K BeadChip） |
NAFLD：64症例 （日本人） |
堀田 紀久子 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の住民ゲノム参照パネルと3層オミックスパネルの作成 |
v1:2018/03/30 |
NGS （WGS、WGBS、RNA-seq） |
配列決定 メチル化解析 発現解析 |
Illumina （HiSeq 2500, HiSeq X） |
197名 （日本人） |
清水 厚志 |
非制限公開 |
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JGAS00000000091 |
大腸がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2000） |
大腸癌：89症例 （日本人） |
山口 俊晴 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000104 |
卵巣がんの再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
卵巣癌：65症例 （日本人） |
加藤 一喜 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000075 |
乳がんの再発/転移に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/03 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
再発・転移性乳癌：65症例 （日本人） |
三木 義男 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000057 |
全ゲノムあるいは全エクソン解析による家族性腫瘍原因遺伝子の同定 |
v1:2017/02/20 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
多発性肺癌同胞：2症例 （日本人） |
加藤 菊也 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000061 |
高齢者がん治療アルゴリズム開発のためのガイドポスト・データベースの構築と必須情報及びその推定モデル |
v1:2016/08/26 |
*サンガー TaqMan qRT-PCR マイクロアレイ COBRA 治療情報 臨床情報 |
配列決定 発現解析 メチル化解析 |
Genetic Analyzer 3130 LightCycler 480II Whole Human Genome DNAマイクロアレイ 4x44K |
【ゲノム】 大腸癌：106症例 胃癌：62症例 肺癌：173症例 【後向き】 大腸癌：313 症例 胃癌：166 症例 肺癌：344 症例 糖尿・腎障害：300 症例 循環器疾患：357 症例 呼吸器疾患：49 症例 （日本人） |
西山 正彦 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000089 |
患者腫瘍移植モデルとex vivo培養間のシャトルシステムによる革新的な臨床効果評価技術の開発 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
大腸癌：8症例 肺癌：2症例 子宮頚部小細胞癌：2症例 （日本人） |
井上 正宏 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000060 |
癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序の解明 |
v1:2016/08/01 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
大腸癌：9症例 （日本人） |
三森 功士 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000076 |
卵巣明細胞腺癌に対する新規バイオマーカーの検索と化学療法感受性に関する後方視的検討 |
v1:2017/05/18 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
卵巣明細胞腺癌：55症例 （日本人） |
杉山 徹 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000065 |
ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明 |
v1:2017/07/10 |
NGS （PCR amplicon Seq） |
配列決定 |
Nanopore （MinION） |
肺腺癌：8症例 （日本人） |
河野 隆志 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000064 |
神経筋疾患、ウイルス性疾患におけるRNA発現プロファイル解析 |
v1:2016/12/09 |
NGS （small RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
神経筋疾患：3症例 （日本人） |
横田 隆徳 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000115 |
バート・ホッグ・デュベ症候群の分子病態解明と新規の診断マーカーおよび治療標的分子の探索研究 |
v1:2018/05/11 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000） |
バート・ホッグ・デュベ症候群：15症例 （日本人） |
矢尾 正祐 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
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ナルコレプシーおよび各種睡眠障害の感受性遺伝子の同定と機能解析 |
v1:2017/12/26 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （SNP Array 6.0） |
ナルコレプシー：409症例 対照：1562名 真性過眠症：125症例 対照：562名 （日本人） |
徳永 勝士 |
非制限公開 |
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テーラーメイド医療を目指した肝炎ウイルスデータベース構築に関する研究 |
v1:2018/02/27 v2:2018/09/25 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （SNP Array 6.0、Axiom ASI） |
NVR：78症例 VR：64症例 SVR：51症例 Plt減少-：196症例 Plt減少+：107症例 Hb減少-：209症例 Hb減少+：94症例 SVR後肝癌を発症した群：123症例 SVR後肝癌を発症していない群：333症例 （日本人） |
田中 靖人 |
非制限公開 |
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B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索研究 |
v1:2017/09/25 v2:2019/02/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （SNP Array 6.0、Axiom ASI） |
HBV保有：181症例 HBV排除：185症例 対照：184名 HBV陽性肝がん：473症例 HBV保有（慢性肝炎患者および無症候キャリア）：516症例 （日本人） |
溝上 雅史 |
非制限公開 |
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日本人原発性胆汁性肝硬変の発症・進展に関わる遺伝因子の網羅的遺伝子解析 |
v1:2016/10/05 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （Axiom ASI） |
PBC：487症例 対照：476名 （日本人） |
中村 稔 |
非制限公開 |
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JGAS00000000120 |
日本人健常者におけるゲノム全域のSNP解析 |
v1:2017/09/26 v2:2017/10/03 |
SNP-chip |
ゲノムワイド健常者遺伝子型 |
Affymetrix （Axiom ASI/6.0） |
419名 （日本人） |
徳永 勝士 |
制限（Type I） 非制限公開 |
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JGAS00000000070 |
バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究（肺がん） |
v1:2016/10/28 |
NGS （CAGE-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
肺癌：97症例 （日本人） |
林崎 良英 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000108 |
胸腹部腫瘍の長期治療成績に関する分子生物学的研究 環境因子が関与する腫瘍のゲノム解析 |
v1:2017/10/16 |
アレイCGH NGS（WGS、Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （MiSeq, HiSeq X-10） |
悪性中皮腫患：32症例 （日本人、米国人） |
大村谷 昌樹 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000073 JGAS00000000107 |
生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
v1:2017/09/25 v2:2017/12/26 v3:2018/06/26 |
NGS（WGBS、ChIP-seq、RNA-seq、small RNA-seq） |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 1500/2500） |
胎盤もしくは子宮の細胞、ヒト胎盤幹細胞：計39検体 （日本人） |
佐々木 裕之 （IHEC） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000077 JGAS00000000096 |
腫瘍細胞におけるTGF-βファミリーシグナルの網羅的解析 |
v1:2019/02/08 |
NGS （RNA-seq、WGS） |
発現解析 配列決定 |
Illumina（GAIIx） Thermo Fisher Scientific（Ion Proton） |
脳腫瘍：2症例 （日本人） |
宮園 浩平 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000078 JGAS00000000079 JGAS00000000080 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 （COCシリーズ） |
v1:2016/11/18 |
NGS （WGBS ChIP-seq RNA-seq） |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
大腸粘膜吸収上皮細胞：12種類 （日本人） |
金井 弥栄 （IHEC） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000095 JGAS00000000105 JGAS00000000113 |
悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明 |
v1:2017/09/04 v2:2018/01/22 v3:2019/02/12 |
NGS （WGS、Exome、RNA-seq）、メチル化アレイ、SNP-chip |
配列決定 発現解析 メチル化解析 CNV解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500, Infinium Human MethylationEPIC BeadChip, HumanOmni2.5-8 BeadChip） |
乳癌：68症例 肺腺癌：43症例 大腸癌：150症例 （日本人） |
間野 博行 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000092 |
大腸前がん病変および早期大腸がんにおける遺伝子解析および発がん機序の解明 |
v1:2018/07/30 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2500） |
大腸腺腫、大腸癌早期病変：計10症例 （日本人） |
三森 功士 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000090 |
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析（小児T細胞性急性リンパ性白血病） |
v1:2017/05/25 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
小児T-ALL：123症例 （日本人） |
滝田 順子 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000094 |
骨髄不全症候群における血球の質に関する検討 |
v1:2018/05/25 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2500） |
第6染色体短腕の片親性ダイソミー陽性再生不良性貧血：5症例 （日本人） |
中尾 眞二 （ゲノム支援） |
制限（Type I） |
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JGAS00000000085 |
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析 |
v1:2017/04/24 |
RNA-seq SNP-chip |
eQTL解析 |
Illumina （Hiseq 2500, Infinium OmniExpressExome BeadChips） |
健常者：105名 （日本人） |
山本 一彦 |
制限（Type I） 非制限公開 |
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JGAS00000000098 |
EBウイルス関連リンパ腫を発症した原発性免疫不全症候群の原因遺伝子探索に関する研究 |
v1:2018/05/11 |
NGS （Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （Miseq） |
原発性免疫不全症：2症例 （日本人） |
岩谷 靖雅 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000109 |
シークエンス解析によるがんゲノム研究：胆道がん |
v1:2018/02/27 |
NGS （WGS、Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 2000/2500） |
胆道癌：95症例 （日本人） |
中川 英刀 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000099 |
基底細胞母斑症候群患者からのinduced pluripotent stem （iPS）細胞の樹立および病態の解明、骨移植への臨床応用 |
v1:2017/10/02 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2500/4000） |
基底細胞母斑症候群：４症例 （日本人） |
東 俊文 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000111 |
精神疾患発症にかかわる関連遺伝子の探索および解析 |
v1:2017/06/26 |
メチル化アレイ |
メチル化解析 |
Illumina （Human Methylation 450K BeadChip） |
パニック症：48症例 対照健常者：48名 （日本人） |
徳永 勝士 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000103 |
胃腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明 |
v1:2017/07/31 |
NGS （RNA-seq、Amplicon-seq） |
発現解析 |
Illumina （HiSeq 2000, MiSeq） |
びまん性胃癌：30症例 （日本人） |
石川 俊平 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000112 （JGA00000000122） |
ヒト胎盤幹細胞の樹立と細胞特性に関する基礎的研究 |
v1:2017/12/14 |
NGS（WGBS、ChIP-seq、RNA-seq、miRNA-seq） |
発現解析 メチル化解析 ヒストン修飾 |
Illumina （HiSeq 1500/2500） |
ヒト胎盤幹細胞：2系統 （日本人） |
有馬 隆博 |
制限（Type I） |
|
日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究 |
v1:2017/12/18 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Illumina （HumanCoreExome BeadChip） |
乾癬：282症例 対照：426名 （日本人） |
岡田 随象 |
非制限公開 |
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JGAS00000000125 |
神経変性疾患のエピジェネティクス解析 |
v1:2017/12/11 |
メチル化アレイ |
メチル化解析 |
Illumina （Human Methylation 450K BeadChip） |
アルツハイマー病：30症例 対照健常者：30名 （日本人） |
岩田 淳 |
制限（Type I） |
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JGAS00000000124 |
バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究（子宮体がん） |
v1:2017/12/11 |
NGS （CAGE-seq） Sanger-seq |
発現解析 配列決定 |
Illumina （HiSeq 2500） Thermo Fisher Scientific（ABI）3500 Genetic Analyzer |
子宮体癌：17症例 （日本人） |
林崎 良英 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000126 |
NASHの発症、進展を規定するメカニズム解析 |
v1:2019/01/31 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Illumina (Human610-Quad BeadChip、HumanCoreExome BeadChip、HumanOmni2.5-Quad BeadChip) |
NAFLD患者：902症例 対照健常者：7672名 （日本人） |
松田 文彦 |
制限(Type I) |
|
JGAS00000000129 |
ヒト上皮成長因子受容体（EGFR）遺伝子変異をもつ肺癌家系における肺癌発癌関連遺伝子同定に関する研究 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2000） |
EGFR遺伝子変異をもつ肺癌：3症例（1家系） （日本人） |
菊地 利明 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000127 |
制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究 |
v1:2018/11/05 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Thermo Fisher Scientific （Ion S5） |
クローン病：3症例 大腸癌：4症例（非腫瘍組織） （日本人） |
坂口 志文 |
制限（Type I） |
|
小児ネフローゼ症候群の疾患感受性遺伝子及び薬剤感受性遺伝子同定研究 |
v1:2018/04/27 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （Japonica Array v1） |
小児ネフローゼ症候群：224症例 対照健常者：419名 （日本人） |
飯島 一誠 |
非制限公開 |
|
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JGAS00000000153 |
慢性好酸球性炎症疾患の網羅的遺伝子解析と網羅的蛋白質解析に関する研究 |
v1:2018/10/29 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina （Hiseq 2000） |
慢性副鼻腔炎：6症例 （日本人） |
藤枝 重治 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000131 |
神経疾患患者からのiPS細胞の樹立とそれを用いた疾患解析に関する研究 |
v1:2018/04/06 |
NGS （ChIP-seq） |
メチル化解析 |
Illumina （Hiseq 2500） |
CHARGE症候群：2症例 （日本人） |
岡野 栄之 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000150 |
ＰＯＥＭＳ症候群の骨髄細胞における遺伝子異常の網羅的解析 造血器腫瘍と骨髄ニッチ細胞の遺伝子異常解析による分子病態の解明と新規治療薬開発の基盤構築 |
v1:2019/01/18 |
NGS （Exome、Target Capture、RNA-seq） |
配列決定 発現解析 |
Illumina （HiSeq 1500/2500、MiSeq） |
POEMS症候群：20症例 多発性骨髄腫：4症例 MGUS：5症例 （日本人） |
堺田 恵美子 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000132 |
発達障害のエピゲノム解析 |
v1:2018/11/20 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Thermo Fisher Scientific （Ion Proton） |
Williams症候群：6症例 対照健常者：8名 （日本人） |
木村 亮 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000137 |
ベトナムにおけるダイオキシン関連疾患のゲノムシークエンス解析 |
v1:2018/09/07 |
NGS （WGS） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2500） |
ダイオキシン暴露者（退役軍人）とその妻と知的障害を持つ子の9トリオ（計27名） （ベトナム人） |
中川 英刀 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000086 |
胃がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2000） |
胃癌：79症例 （日本人） |
山口 俊晴 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000087 |
Bリンパ腫の転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （Hiseq 2000） |
Bリンパ腫：60症例 （日本人） |
山口 俊晴 （P-DIRECT） |
制限（Type I） |
|
B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究 |
v1:2018/05/22 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix （Axiom ASI） |
B型肝炎ワクチン接種者：1,193名 （日本人） |
溝上 雅史 |
非制限公開 |
|
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JGAS00000000144 |
1型糖尿病関連遺伝子群の多施設共同研究 |
v1:2018/12/21 |
NGS （Target Capture） |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific （Ion Proton） |
1型糖尿病：32症例 （日本人） |
池上 博司 |
制限（Type I） |
|
JGAS00000000136 |
疾患特異的iPS細胞を用いた創薬・疾患研究 |
v1:2018/07/10 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina （HiSeq 1500） |
RALD患者：1症例 （日本人） |
大津 真 |
制限（Type I） |
|
DRA007187 |
先天性インプリント異常症の診断と生殖医療の安全性評価 |
v1:2019/02/19 |
NGS （RRBS） |
メチル化解析 |
Illumina （HiSeq 2500） |
生殖補助医療を受けたSRS患者：5症例 生殖補助医療を受けていないSRS患者：5症例 対象健常児：10名 （日本人） |
有馬 隆博 |
非制限公開 |
|
JGAS00000000151 |
シークエンス解析によるがんゲノム研究：肝臓がん |
v1:2018/10/22 |
NGS （WGS、RNA-seq） |
配列決定 発現解析 |
Illumina （HiSeq 2000/2500, Genome Analyzer IIx） |
肝臓癌：270症例 （日本人） |
中川 英刀 |
制限（Type I） |
|
精神・神経疾患治療薬及びがん治療薬におけるファーマコゲノミクス研究 |
v1:2018/12/14 |
NGS （Target Capture） |
配列決定 |
Illumina （MiSeq） |
精神・神経疾患及び癌：計990症例 （日本人） |
莚田 泰誠 |
非制限公開 |
|
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JGAS00000000160 |
東北メディカル・メガバンク事業地域住民コホート調査 |
v1:2018/12/14 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Illumina （Infinium OmniExpressExome-8） |
住民コホートに参加した9,187名 （日本人） |
長﨑 正朗 |
制限（Type I） |
・ DDBJ Sequence Read Arichive （DRA）サイトにおいて、the European Sequence Read Archive （ERA）およびthe Sequence Read Archive （SRA）に登録済みデータを検索できます。
・ Database Center for Life Science （DBCLS） SRAサイトからの検索も可能です。
