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| Research ID | 研究題目 | 公開日 | データの種類 | 研究方法 | 手法 |
参加者 （対象集団） | 提供者 | アクセス制限 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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JGAS00000000002 |
SCA31罹患患者のゲノム解析データ |
v1:2013/12/01 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
SCA31：1症例 （日本人） |
森下真一 |
制限(Type I) |
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DRA000908 |
関節リウマチ患者及び健常人における HLA領域の塩基配列比較解析 |
v1:2013/07/01 |
NGS (Target Capture) |
HLA領域 配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
33検体 （セルライン） |
井ノ上逸朗 |
非制限公開 |
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JGAS00000000001 |
上皮成長因子受容体遺伝子異変を有する 肺腺癌の体細胞性遺伝子変異プロファイル 解明のための分子疫学的研究 |
v1:2014/07/11 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (GAIIx) |
肺腺癌：97症例 （日本人） |
後藤功一 |
制限(Type I) |
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DRA001273 JGAS00000000032 DRA003791 |
難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究 |
v1:2014/01/27 v2:2017/02/24 |
NGS （Target Capture） |
9遺伝子領域 69遺伝子領域 配列決定 |
Life technoligies (Ion PGM) |
Usher症候群：17症例 非症候群性難聴：44症例 （日本人） |
宇佐美真一 |
非制限公開 制限(Type I) |
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JGAS00000000004 |
脳腫瘍のゲノム・遺伝子解析と その臨床病理学的意義の解明 |
v1:2014/01/31 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
6症例23検体 （日本人） |
斉藤延人 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000005 |
ヒトTh17細胞の活性化前後の遺伝子発現 |
v1:2015/02/12 |
NGS (RNA-seq) |
発現解析 |
Applied BioSystems (AB5500 GA) |
1名 （日本人） |
巌本三壽 |
制限（Type I） |
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DRA003802 |
ヒト初期発生にかかわる細胞の DNAメチル化解析基盤研究 |
v1:2014/12/24 v2:2015/01/07 v3:2015/08/03 |
NGS (PBAT) |
メチル化シトシン同定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
11検体 （日本人） |
有馬隆博 |
非制限公開 |
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JGAS00000000008 |
脾類上皮嚢腫関連遺伝子の探索 |
v1:2015/06/23 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
脾類上皮嚢腫：8症例 （日本人） |
松藤凡 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000015 |
B型肝炎ウイルスのヒトゲノム内組み込み によるエピジェネティックな修飾 |
v1:2015/10/07 |
NGS (Target Capture) |
HBV組込部位 配列決定 |
Roche GS FLX Titanium |
2検体（セルライン） HBV感染肝癌：8症例 （日本人） |
山本博幸 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000012 |
ながはま0次コホート事業 |
v1:2015/08/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常人遺伝子型 |
Illumina (Human610-Quad, HumanOmni2.5-4/2.5-8/2.5S-8, HumanExome-12, HumanCoreExome-12) |
3712名 （日本人） |
松田文彦 |
制限(Type I) |
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日本PGxデータサイエンスコンソーシアム PGx研究のための日本人健常者2994名の SNP遺伝子型データ |
v1:2014/10/16 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina (HumanOmni2.5-8) |
2994名 （日本人） |
末松浩嗣 |
非制限公開 |
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JGAS00000000101 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2014/09/30 v2:2015/12/28 （JSNP） v3:2016/01/10 v4:2016/01/27 v5:2017/05/18 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連解析 |
Illumina (Human610-Quad, HumanHap550v3, HumanOmniExpress-12, HumanExome, OmniExpressExome) Perlegen Sciences (high-density oligonucleotide array) Hologic Japan (Invader) |
心筋梗塞：1666症例、対照：3198名 健常者：934名（JSNP） 35疾患：各約190症例（JSNP） 食道癌：182症例（JSNP） ALS：92症例（JSNP） T2DM：9817症例、対照：6763名 T2DM：5646症例、対照：19,420名 AD：1472症例、対照：7966名 AF：8180症例、対照：28,612名 （日本人） |
久保充明 |
非制限公開 制限(Type I) |
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ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の 住民ゲノム参照パネルの作成 |
v1:2014/10/14 |
NGS (WGS) |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina (HiSeq 2500) |
1070名 （日本人） |
山本雅之 |
非制限公開 |
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DRA002604 |
精巣に発現するタンパク質群の ヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析 |
v1:2016/09/30 |
NGS (RNA-seq、ChIP-seq) |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 1500) |
1名4検体 （日本人） |
大川恭行 |
非制限公開 |
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JGAS00000000021 |
中枢神経原発悪性リンパ腫のエクソーム解析 |
v1:2016/02/22 |
NGS （Exome、RNA-seq） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
PCNSL：41症例 （日本人） |
間野博行 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000009 |
神経筋変性疾患の遺伝子解析研究 |
v1:2015/02/03 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
神経筋変性疾患：14症例 対照：7名 （日本人） |
辻省次 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000011 |
消化器癌の発癌や進展に 深く関与しうる遺伝子、並びに 非コードRNAの量的・質的な異常の探索 |
v1:2015/04/01 |
NGS (RNA-seq) |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
消化器癌：17症例（32検体） （日本人） |
篠村恭久 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000013 |
筋萎縮性側索硬化症の遺伝子解析研究 |
v1:2015/01/08 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
家族性ALS：11症例 （日本人） |
田中章景 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000014 |
精神神経疾患の原因解明および 診断法・治療法の開発に関する研究 |
v1:2015/01/26 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
健常一卵性双生児 3組6名 （日本人） |
加藤忠史 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000017 |
同種造血幹細胞移植後 ドナー由来白血病発症にかかわる 分子機構の解析 |
v1:2015/02/02 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
白血病：1症例 ドナー：1名 （日本人） |
清井仁 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000016 |
生活習慣病、動脈硬化性疾患、ならびに 抗加齢に関する遺伝疫学研究 |
v1:2015/01/28 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
III度以上の本態性 高血圧：30症例 （日本人） |
三木哲郎 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000023 |
造血器腫瘍における 遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/04/16 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (GAIIx, HiSeq 2000/2500) |
MDS：13症例 CMML：1症例 （日本人） |
小川誠司 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000024 JGAS00000000040 |
侵襲性歯周炎のヒト全ゲノム解析と遺伝子多型解析 |
v1:2016/07/28 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
侵襲性歯周炎：44症例 |
村上伸也 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000018 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2015/06/02 |
SNP-chip |
HLA領域 HLAアリルおよび 領域内遺伝子型決定 |
Illumina (HumanOmniExpress, HumanExome, Immunochip, HumanHap550) |
健常者908名 （日本人） |
久保充明 （BBJ） |
制限(Type I) |
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Stevens-Johnson症候群に対する 遺伝子多型解析 |
v1:2016/03/09 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連解析 |
Affymetrix (Axiom ASI) |
SJS：117症例 対照：691名 （日本人） |
上田真由美 （ゲノム支援） |
非制限公開 |
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JGAS00000000022 |
婦人科臓器に発生する悪性腫瘍の 発症に関連する分子生物学的異常の検索 |
v1:2015/04/21 |
SNP-chip |
ゲノムワイド CNV解析 |
Affymetrix (Human Mapping 250K Nsp Array) |
卵巣癌：57症例 （日本人） |
織田克利 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000042 |
磁気共鳴画像装置で得られた脳画像の臨床評価尺度データベース構築と多施設による共同運用 |
v1:2015/11/20 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
Philips (Achieva) |
統合失調症：37症例 単極うつ病：8症例 双極性障害：2症例 健常者：129例 （日本人） |
笠井清登 |
制限(Type I) 非制限公開 |
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JGAS00000000026 JGAS00000000027 JGAS00000000028 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 （HPCシリーズ） |
v1:2016/07/22 |
NGS (WGBS ChIP-seq RNA-seq) |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
肝細胞：8種類 （日本人） |
金井弥栄 （IHEC） |
制限(Type I) |
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DRA003516 |
ヒト唾液由来エキソソームの 機能解析に関する研究 |
v1:2015/04/28 |
NGS (RNA-seq) |
発現解析 |
Illumina (GAIIx) |
1名3検体 |
矢ノ下良平 |
非制限公開 |
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JGAS00000000037 |
小細胞肺癌の網羅的ゲノム解析による 新たな治療標的の探索を目指した研究 |
v1:2015/10/01 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
SCLC：51症例 （日本人） |
後藤功一 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000036 |
固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/09/16 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
RMS：16症例 PPB：7症例 （日本人） |
滝田順子 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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DRA003736 |
全エクソームキャプチャプラットフォーム間の 性能比較 |
v1:2015/08/01 |
NGS (Exome) |
キャプチャ方法の 性能比較 |
Illumina (HiSeq 2500) |
HapMap-JPT：2検体 （日本人） |
久保充明 |
非制限公開 |
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JGAS00000000035 |
関節リウマチ感受性遺伝子を用いた 関節リウマチ病態の遺伝診断法の開発研究 |
v1:2015/09/24 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
RA：39症例 対照：10名（Pooled） （日本人） |
光永滋樹 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000041 |
家族性致死性不整脈の病因解明 |
v1:2015/11/18 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
家族性致死性不整脈：11症例 （日本人） |
蒔田直昌 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000039 |
消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に 対する獲得耐性機構の解明 |
v1:2016/12/27 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 1500) |
イマチニブ耐性消化管間質腫瘍：4症例 （日本人） |
高橋 剛 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000038 |
生殖発生に関わる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
v1:2016/09/16 |
NGS (WGS、Exome、RNA-seq、BS-seq) |
配列決定 発現解析 メチル化解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
ヒト胎盤：28検体 母体血：26検体 （日本人） |
有馬隆博 （IHEC） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000052 |
肝胆膵癌の早期発見、進行、予後予測、 治療効果予測に関わる因子の研究 |
v1:2017/01/12 |
NGS （Exome Target Capture） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
原発性肝細胞癌：33症例 （日本人） |
田中真二 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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顎口腔領域の形質（性質や特徴） に関与する遺伝子の探索 |
v1:2016/03/02 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連解析 |
Illumina (HumanOmniExpress BeadChip) |
変性顎関節症：146症例 非罹患：374名 第三大臼歯先天性欠如有：149症例 無欠如：338名 （日本人、韓国人） |
山口徹太郎 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000051 |
アルツハイマー病総合診断体系実用化プロジェクト （J-ADNI全国臨床研究） |
v1:2016/01/29 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
MCI：234名 AD：154名 健常高齢者群：149名 （日本人） |
岩坪 威 |
制限(Type I) 非制限公開 |
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DRA004162 |
ヒトレトロウイルス感染症に関する研究 |
v1:2016/10/31 |
NGS (ChIP-seq) |
メチル化解析 |
Illumina (NextSeq 500) |
ATL細胞株：1検体 |
佐藤賢文 |
非制限公開 |
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JGAS00000000047 |
思春期・若年成人急性リンパ芽球性白血病におけるトランスクリプトーム解析 |
v1:2016/03/29 |
NGS (RNA-seq) |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
フィラデルフィア染色体陰性ALL：99症例 フィラデルフィア染色体陽性ALL：3症例 セルライン：5検体 正常血球細胞：8検体 |
間野博行 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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DRA004251 |
次世代シークエンサーを用いた十二指腸・ファーター乳頭部腫瘍の全遺伝子のエクソン解析 |
v1:2016/02/05 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
ファーター乳頭部がん：60症例 （日本人、米国人） |
谷内田真一 |
非制限公開 |
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JGAS00000000053 |
B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定 |
v1:2016/09/30 |
NGS （CAGE-seq） |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2000) |
HBVキャリア：8症例 （日本人） |
松浦知和 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000062 |
悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定 |
v1:2016/07/20 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
悪性中皮腫患者：38症例 （日本人） |
中野孝司 （P-DIRECT） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000059 |
非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析 |
v1:2017/02/20 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
NAFLD：60症例 （日本人） |
堀田紀久子 （ゲノム支援） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000057 |
全ゲノムあるいは全エクソン解析による家族性腫瘍原因遺伝子の同定 |
v1:2017/02/20 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
多発性肺癌同胞：2症例 （日本人） |
加藤菊也 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000061 |
高齢者がん治療アルゴリズム開発のためのガイドポスト・データベースの構築と必須情報及びその推定モデル |
v1:2016/08/26 |
*サンガー TaqMan qRT-PCR マイクロアレイ COBRA 治療情報 臨床情報 |
配列決定 発現解析 メチル化解析 |
Genetic Analyzer 3130 LightCycler 480II Whole Human Genome DNAマイクロアレイ 4x44K |
【ゲノム】 大腸癌：106症例 胃癌：62症例 肺癌：173症例 【後向き】 大腸癌：313 症例 胃癌：166 症例 肺癌：344 症例 糖尿・腎障害：300 症例 循環器疾患：357 症例 呼吸器疾患：49 症例 （日本人） |
西山正彦 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000060 |
癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序の解明 |
v1:2016/08/01 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
大腸癌：9症例 （日本人） |
三森功士 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000076 |
卵巣明細胞腺癌に対する新規バイオマーカーの検索と化学療法感受性に関する後方視的検討 |
v1:2017/05/18 |
NGS （Exome） |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
卵巣明細胞腺癌：55症例 （日本人） |
杉山 徹 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000064 |
神経筋疾患、ウイルス性疾患におけるRNA発現プロファイル解析 |
v1:2016/12/09 |
NGS （small RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
神経筋疾患：3症例 （日本人） |
横田隆徳 |
制限(Type I) |
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日本人原発性胆汁性肝硬変の発症・進展に関わる遺伝因子の網羅的遺伝子解析 |
v1:2016/10/05 |
SNP-chip |
ゲノムワイド関連解析 |
Affymetrix (Axiom ASI) |
PBC：487症例 対照：476名 （日本人） |
中村 稔 |
非制限公開 |
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JGAS00000000070 |
バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究 |
v1:2016/10/28 |
NGS （CAGE-seq） |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
肺癌：97症例 （日本人） |
林崎良英 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000078 JGAS00000000079 JGAS00000000080 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 （COCシリーズ） |
v1:2016/11/18 |
NGS （WGBS ChIP-seq RNA-seq） |
発現解析 メチル化解析 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
大腸粘膜吸収上皮細胞：12種類 （日本人） |
金井弥栄 （IHEC） |
制限(Type I) |
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JGAS00000000090 |
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析（小児T細胞性急性リンパ性白血病） |
v1:2017/05/25 |
NGS （RNA-seq） |
発現解析 |
Illumina (HiSeq 2500) |
小児T-ALL：123症例 （日本人） |
滝田順子 |
制限(Type I) |
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JGAS00000000085 |
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析 |
v1:2017/04/24 |
RNA-seq SNP-chip |
eQTL解析 |
Illumina (Hiseq 2500、Infinium OmniExpressExome BeadChips） |
健常者：105名 （日本人） |
山本一彦 |
制限(Type I) 非制限公開 |
・ DDBJ Sequence Read Arichive (DRA)サイトにおいて、the European Sequence Read Archive (ERA)およびthe Sequence Read Archive (SRA)に登録済みデータを検索できます。
・ Database Center for Life Science (DBCLS) SRAサイトからの検索も可能です。
