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Research ID | 研究題目 | 公開日 | データの種類 | 研究方法 | 手法 |
参加者 (対象集団) | 提供者 | アクセス制限 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
JGAS000002 |
SCA31罹患患者のゲノム解析データ |
v1:2013/12/01 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
SCA31:1症例 (日本人) |
森下 真一 |
制限(Type I) |
DRA000908 |
関節リウマチ患者及び健常人における HLA領域の塩基配列比較解析 |
v1:2013/07/01 |
NGS (Target Capture) |
HLA領域 配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
33検体 (細胞株) |
井ノ上 逸朗 |
非制限公開 |
JGAS000001 |
上皮成長因子受容体遺伝子異変を有する 肺腺癌の体細胞性遺伝子変異プロファイル 解明のための分子疫学的研究 |
v1:2014/07/11 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (Genome Analyzer IIx) |
肺腺癌:97症例 (日本人) |
後藤 功一 |
制限(Type I) |
DRA001273 JGAS000032 DRA003791 JGAS000093 JGAS000123 JGAS000166 |
難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究 |
v1:2014/01/27 v2:2017/02/24 v3:2017/06/19 v4:2018/02/13 v5:2019/04/18 |
NGS (Target Capture) |
9遺伝子領域 69遺伝子領域 89遺伝子領域 配列決定 |
Life technoligies (Ion PGM/IonProton) Illumina (HiSeq 2000) |
Usher症候群:17症例 非症候群性難聴:121症例 (日本人) |
宇佐美 真一 |
非制限公開 制限(Type I) |
JGAS000004 JGAS000106 JGAS000146 |
脳腫瘍のゲノム・遺伝子解析と その臨床病理学的意義の解明 |
v1:2014/01/31 v2:2017/06/05 v3:2017/09/01 v4:2019/02/13 |
NGS (Exome、RNA-seq) メチル化アレイ |
配列決定 発現 メチル化 |
Illumina (HiSeq 2000、HumanMethylation450 BeadChip) |
脳腫瘍:6症例+16症例 グリオーマ(小脳:17症例、視床:14症例、大脳:8症例) グリオーマ:94症例 (日本人) |
斉藤 延人 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000005 |
ヒトTh17細胞の活性化前後の遺伝子発現 |
v1:2015/02/12 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Applied BioSystems (AB5500 GA) |
健常者:1名 (日本人) |
巌本 三壽 |
制限(Type I) |
JGAS000007 |
ヒルシュスプルング病および ヒルシュスプルング類縁疾患の 遺伝要因および発症機構解明に関する研究 |
v1:2018/01/29 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
ヒルシュスプルング:5症例 家族:6例 (日本人) |
松藤 凡 |
制限(Type I) |
DRA003802 |
ヒト初期発生にかかわる細胞の DNAメチル化解析基盤研究 |
v1:2014/12/24 v2:2015/01/07 v3:2015/08/03 |
NGS (PBAT) |
メチル化シトシン同定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
11検体 (日本人) |
有馬 隆博 |
非制限公開 |
JGAS000008 |
脾類上皮嚢腫関連遺伝子の探索 |
v1:2015/06/23 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
脾類上皮嚢腫:8症例 (日本人) |
松藤 凡 |
制限(Type I) |
JGAS000015 |
B型肝炎ウイルスのヒトゲノム内組み込み によるエピジェネティックな修飾 |
v1:2015/10/07 |
NGS (Target Capture) |
HBV組込部位 配列決定 |
Roche GS FLX Titanium |
2検体(セルライン) HBV感染肝癌:8症例 (日本人) |
山本 博幸 |
制限(Type I) |
JGAS000012 |
ながはま0次コホート事業 |
v1:2015/08/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常者遺伝子型 |
Illumina (Human610-Quad、HumanOmni2.5-4/2.5-8/2.5S-8、HumanExome-12、HumanCoreExome-12) |
健常者:3712名 (日本人) |
松田 文彦 |
制限(Type I) |
日本PGxデータサイエンスコンソーシアム PGx研究のための日本人健常者2994名の SNP遺伝子型データ |
v1:2014/10/16 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina (HumanOmni2.5-8) |
健常者:2994名 (日本人) |
末松 浩嗣 |
非制限公開 |
|
JGAS000101 JGAS000114 JGAS000140 JGAS000203 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2014/09/30 v2:2015/12/28 (JSNP) v3:2016/01/10 v4:2016/01/27 v5:2017/05/18 v6:2017/09/08 v7:2018/04/04 v8:2018/05/01 v9:2018/08/07 v10:2018/08/13 v11:2018/10/16 v12:2018/12/10 v13:2019/01/25 v14:2019/03/26 v15:2019/09/27 v16:2019/10/07 v17:2019/10/08 v18:2019/11/26 v19:2020/04/20 v20:2020/08/17 v21:2020/08/25 |
SNP-chip NGS (WGS、Target Capture) |
ゲノムワイド 関連 配列決定 |
Illumina (Human610-Quad、HumanHap550v3、HumanOmniExpress-12、HumanExome、OmniExpressExome、HiSeq 2500) Perlegen Sciences (high-density oligonucleotide array) Hologic Japan (Invader) |
心筋梗塞:1666症例、対照:3198名 健常者:934名(JSNP) 35疾患:各約190症例(JSNP) 食道癌:182症例(JSNP) ALS:92症例(JSNP) T2DM:9817症例、対照:6763名 T2DM:5646症例、対照:19,420名 AD:1472症例、対照:7966名 AF:8180症例、対照:28,612名 BMI:158,284名 Genotypeデータ:182,505名 POAG:3980症例、対照:18,815名 58臨床検査値:162,255名 初潮年齢データを有する女性:67,029名 閉経年齢データを有する女性:43,861名 BBJ第1コホート:1,026名 乳癌:7,104症例、対照:23,731名 2型糖尿病腎症:2,809症例、2型糖尿病対照:5,592名 T2DM:36,614症例、対照:155,150名 喫煙習慣データ:165,436名 BBJ第1コホート:1,037名、1000ゲノムプロジェクト(Phase3v5):2,504名 身長:159,095名 遺伝性前立腺癌:7,636症例、対照:12,366名 42疾患:212,453症例 食習慣:165,084名 冠動脈疾患:25,892症例、対照:142,336名 (日本人) |
久保 充明 |
非制限公開 制限(Type I) |
JGAS000159 |
ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の 住民ゲノム参照パネルの作成 |
v1:2014/10/14 v2:2018/12/27 v3:2019/01/11 |
NGS (WGS) |
ゲノムワイド 健常者内頻度 |
Illumina (HiSeq 2500) |
健常者:3552名 (日本人) |
山本 雅之 |
非制限公開 |
DRA002604 |
精巣に発現するタンパク質群の ヒト精子細胞における発現及び染色体局在解析 |
v1:2016/09/30 |
NGS (RNA-seq、ChIP-seq) |
発現 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 1500) |
健常者:1名(4検体) (日本人) |
大川 恭行 |
非制限公開 |
JGAS000021 |
中枢神経原発悪性リンパ腫のエクソーム解析 |
v1:2016/02/22 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2000) |
PCNSL:41症例 (日本人) |
間野 博行 |
制限(Type I) |
JGAS000009 |
神経筋変性疾患の遺伝子解析研究 |
v1:2015/02/03 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
神経筋変性疾患:14症例 対照:7名 (日本人) |
辻 省次 |
制限(Type I) |
JGAS000011 |
消化器癌の発癌や進展に 深く関与しうる遺伝子、並びに 非コードRNAの量的・質的な異常の探索 |
v1:2015/04/01 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
消化器癌:17症例(32検体) (日本人) |
篠村 恭久 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000013 |
筋萎縮性側索硬化症の遺伝子解析研究 |
v1:2015/01/08 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
家族性ALS:11症例 (日本人) |
田中 章景 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000014 |
精神神経疾患の原因解明および 診断法・治療法の開発に関する研究 |
v1:2015/01/26 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
健常一卵性双生児:3組6名 (日本人) |
加藤 忠史 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000017 |
同種造血幹細胞移植後 ドナー由来白血病発症にかかわる 分子機構の解析 |
v1:2015/02/02 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
白血病:1症例 ドナー:1名 (日本人) |
清井 仁 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000016 |
生活習慣病、動脈硬化性疾患、ならびに 抗加齢に関する遺伝疫学研究 |
v1:2015/01/28 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
III度以上の本態性 高血圧:30症例 (日本人) |
三木 哲郎 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000023 |
造血器腫瘍における 遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/04/16 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (Genome Analyzer IIx、HiSeq 2000/2500) |
MDS:13症例 CMML:1症例 (日本人) |
小川 誠司 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000024 JGAS000040 |
侵襲性歯周炎のヒト全ゲノム解析と遺伝子多型解析 |
v1:2016/07/28 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
侵襲性歯周炎:44症例 (日本人) |
村上 伸也 |
制限(Type I) |
JGAS000018 |
オーダーメイド医療の実現プログラム |
v1:2015/06/02 v2:2018/06/05 |
SNP-chip |
HLA領域 HLAアリルおよび 領域内遺伝子型決定 |
Illumina (HumanOmniExpress BeadChip、HumanExome BeadChip、Immunochip、HumanHap550v3 Genotyping BeadChip) |
健常者:908名 (日本人) |
久保 充明 (BBJ) |
制限(Type I) |
Stevens-Johnson症候群に対する 遺伝子多型解析 |
v1:2016/03/09 v2:2020/12/21 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (Axiom ASI) Illumina (HiSeq X Ten) |
SJS:117症例 対照:691名 SJS/TEN:133症例 対照:418名 (日本人) |
上田 真由美 (ゲノム支援) |
非制限公開 |
|
JGAS000022 |
婦人科臓器に発生する悪性腫瘍の 発症に関連する分子生物学的異常の検索 |
v1:2015/04/21 |
SNP-chip |
ゲノムワイド CNV |
Affymetrix (Human Mapping 250K、Nsp Array) |
卵巣癌:57症例 (日本人) |
織田 克利 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000042 JGAS000043 JGAS000044 JGAS000045 |
磁気共鳴画像装置で得られた脳画像の臨床評価尺度データベース構築と多施設による共同運用 |
v1:2015/11/20 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
Philips (Achieva) |
統合失調症:37症例 単極うつ病:8症例 双極性障害:2症例 健常者:129名 (日本人) |
笠井 清登 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000026 JGAS000027 JGAS000028 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 (HPCシリーズ) |
v1:2016/07/22 |
NGS (WGBS ChIP-seq RNA-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
肝細胞:8種類 (日本人) |
金井 弥栄 (IHEC) |
制限(Type I) |
DRA003516 |
ヒト唾液由来エキソソームの 機能解析に関する研究 |
v1:2015/05/01 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (Genome Analyzer IIx) |
健常者:1名(3検体) (日本人) |
矢ノ下 良平 |
非制限公開 |
JGAS000037 |
小細胞肺癌の網羅的ゲノム解析による 新たな治療標的の探索を目指した研究 |
v1:2015/10/01 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
SCLC:51症例 (日本人) |
後藤 功一 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000036 JGAS000046 JGAS000088 JGAS000188 JGAS000204 JGAS000246 |
固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2015/09/16 v2:2017/12/26 v3:2020/05/29 v4:2020/12/14 v5:2020/12/18 |
NGS (Exome、Target Capture、RNA-seq) SNP-chip メチル化アレイ |
配列決定 発現 ゲノムワイド 関連 メチル化 |
Illumina (HiSeq 2000/2500、MiSeq、Infinium MethylationEPIC) Affymetrix (GeneChip Human Mapping 250k Nspl、CytoScan HD arrays) |
RMS:16症例 PPB:7症例 NB:522症例 NB細胞株:39検体 PBL:10症例 HBL:59症例 HBL細胞株:2検体 小児胚細胞腫瘍:51症例 小児高リスク神経芽腫:30症例 (日本人) |
滝田 順子 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
DRA003736 |
全エクソームキャプチャプラットフォーム間の 性能比較 |
v1:2015/08/01 |
NGS (Exome) |
キャプチャ方法の性能比較 |
Illumina (HiSeq 2500) |
HapMap-JPT:2検体 (日本人) |
久保 充明 |
非制限公開 |
JGAS000035 |
関節リウマチ感受性遺伝子を用いた 関節リウマチ病態の遺伝診断法の開発研究 |
v1:2015/09/24 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
RA:39症例 対照:10名(Pooled) (日本人) |
光永 滋樹 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000041 |
家族性致死性不整脈の病因解明 |
v1:2015/11/18 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
家族性致死性不整脈:11症例 (日本人) |
蒔田 直昌 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000039 |
消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に 対する獲得耐性機構の解明 |
v1:2016/12/27 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 1500) |
イマチニブ耐性消化管間質腫瘍:4症例 (日本人) |
高橋 剛 |
制限(Type I) |
JGAS000038 |
生殖発生に関わる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
v1:2016/09/16 |
NGS (WGS、Exome、RNA-seq、BS-seq) |
配列決定 発現 メチル化 |
Illumina (HiSeq 2500) |
ヒト胎盤:28検体 母体血:26検体 (日本人) |
有馬 隆博 (IHEC) |
制限(Type I) |
JGAS000052 |
肝胆膵癌の早期発見、進行、予後予測、 治療効果予測に関わる因子の研究 |
v1:2017/01/12 |
NGS (Exome Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
原発性肝細胞癌:33症例 (日本人) |
田中 真二 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
顎口腔領域の形質(性質や特徴) に関与する遺伝子の探索 |
v1:2016/03/02 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Illumina (HumanOmniExpress BeadChip) |
変性顎関節症:146症例 非罹患:374名 第三大臼歯先天性欠如有:149症例 無欠如:338名 (日本人、韓国人) |
山口 徹太郎 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
|
JGAS000051 |
アルツハイマー病総合診断体系実用化プロジェクト (J-ADNI全国臨床研究) |
v1:2016/01/29 |
脳画像 臨床情報 |
脳画像ベースの病態解明 |
MCI:234名 AD:149名 健常高齢者群:154名 (日本人) |
岩坪 威 |
制限(Type I) 非制限公開 |
|
DRA004162 |
ヒトレトロウイルス感染症に関する研究 |
v1:2016/10/31 |
NGS (ChIP-seq) |
ヒストン修飾 |
Illumina (NextSeq 500) |
ATL細胞株:1検体 (細胞株) |
佐藤 賢文 |
非制限公開 |
JGAS000047 |
思春期・若年成人急性リンパ芽球性白血病におけるトランスクリプトーム解析 |
v1:2016/03/29 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
フィラデルフィア染色体陰性ALL:99症例 フィラデルフィア染色体陽性ALL:3症例 セルライン:5検体 正常血球細胞:8検体 (日本人) |
間野 博行 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
DRA004251 |
次世代シークエンサーを用いた十二指腸・ファーター乳頭部腫瘍の全遺伝子のエクソン解析 |
v1:2016/02/05 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
ファーター乳頭部癌:60症例 (日本人、米国人) |
谷内田 真一 |
非制限公開 |
JGAS000053 |
B型肝炎創薬へ向けてのトランスクリプトーム解析による病態解明と標的同定 |
v1:2016/09/30 |
NGS (CAGE-seq) |
転写開始点同定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
HBVキャリア:8症例 (日本人) |
松浦 知和 |
制限(Type I) |
JGAS000062 JGAS000176 |
悪性中皮腫のプロファイリングによる新規分子標的の同定 |
v1:2016/07/20 v2:2020/04/14 |
NGS (Exome、WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) 10x Genomics (Chromium Controller) |
悪性胸膜中皮腫:38症例 (日本人) |
中野 孝司 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000059 |
非アルコール性脂肪肝疾患のゲノム・エピゲノム解析 |
v1:2017/02/20 |
NGS (RNA-seq) メチル化アレイ |
発現 メチル化 |
Illumina (HiSeq 2500、Human Methylation 450K BeadChip) |
NAFLD:64症例 (日本人) |
堀田 紀久子 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
ヒト全ゲノム解析に基づく高精度の住民ゲノム参照パネルと3層オミックスパネルの作成 |
v1:2018/03/30 |
NGS (WGS、WGBS、RNA-seq) |
配列決定 メチル化 発現 |
Illumina (HiSeq 2500/X) |
197名 (日本人) |
清水 厚志 |
非制限公開 |
|
JGAS000091 |
大腸がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
大腸癌:89症例 (日本人) |
山口 俊晴 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000104 |
卵巣がんの再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
卵巣癌:65症例 (日本人) |
加藤 一喜 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000075 |
乳がんの再発/転移に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/03 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
再発・転移性乳癌:65症例 (日本人) |
三木 義男 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000057 |
全ゲノムあるいは全エクソン解析による家族性腫瘍原因遺伝子の同定 |
v1:2017/02/20 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
多発性肺癌同胞:2症例 (日本人) |
加藤 菊也 |
制限(Type I) |
JGAS000061 |
高齢者がん治療アルゴリズム開発のためのガイドポスト・データベースの構築と必須情報及びその推定モデル |
v1:2016/08/26 |
*サンガー TaqMan qRT-PCR マイクロアレイ COBRA 治療情報 臨床情報 |
配列決定 発現 メチル化 |
Genetic Analyzer 3130 LightCycler 480II Whole Human Genome DNAマイクロアレイ 4x44K |
【ゲノム】 大腸癌:106症例 胃癌:62症例 肺癌:173症例 【後向き】 大腸癌:313 症例 胃癌:166 症例 肺癌:344 症例 糖尿・腎障害:300 症例 循環器疾患:357 症例 呼吸器疾患:49 症例 (日本人) |
西山 正彦 |
制限(Type I) |
JGAS000089 |
患者腫瘍移植モデルとex vivo培養間のシャトルシステムによる革新的な臨床効果評価技術の開発 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
大腸癌:8症例 肺癌:2症例 子宮頸部小細胞癌:2症例 (日本人) |
井上 正宏 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000060 |
癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序の解明 |
v1:2016/08/01 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
大腸癌:9症例 (日本人) |
三森 功士 |
制限(Type I) |
JGAS000076 |
卵巣明細胞腺癌に対する新規バイオマーカーの検索と化学療法感受性に関する後方視的検討 |
v1:2017/05/18 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
卵巣明細胞腺癌:55症例 (日本人) |
杉山 徹 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000065 |
ゲノム解析に基づく肺がんの発生・進展の分子機構の解明 |
v1:2017/07/10 v2:2020/10/19 |
NGS (PCR amplicon Seq、WGS) |
配列決定 |
Nanopore (MinION、PromethION) Illumina (NovaSeq 6000) |
肺腺癌:8+21症例 (日本人) |
河野 隆志 |
制限(Type I) |
JGAS000064 |
神経筋疾患、ウイルス性疾患におけるRNA発現プロファイル解析 |
v1:2016/12/09 |
NGS (small RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
神経筋疾患:3症例 (日本人) |
横田 隆徳 |
制限(Type I) |
JGAS000115 |
バート・ホッグ・デュベ症候群の分子病態解明と新規の診断マーカーおよび治療標的分子の探索研究 |
v1:2018/05/11 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
バート・ホッグ・デュベ症候群:15症例 (日本人) |
矢尾 正祐 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
ナルコレプシーおよび各種睡眠障害の感受性遺伝子の同定と機能解析 |
v1:2017/12/26 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (SNP Array 6.0) |
ナルコレプシー:409症例 対照:1562名 真性過眠症:125症例 対照:562名 (日本人) |
徳永 勝士 |
非制限公開 |
|
テーラーメイド医療を目指した肝炎ウイルスデータベース構築に関する研究 |
v1:2018/02/27 v2:2018/09/25 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (SNP Array 6.0、Axiom ASI) |
NVR:78症例 VR:64症例 SVR:51症例 Plt減少-:196症例 Plt減少+:107症例 Hb減少-:209症例 Hb減少+:94症例 SVR後肝癌を発症した群:123症例 SVR後肝癌を発症していない群:333症例 (日本人) |
田中 靖人 |
非制限公開 |
|
B型肝炎ウイルス感染の病態別における宿主遺伝因子の探索研究 |
v1:2017/09/25 v2:2019/02/19 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (SNP Array 6.0、Axiom ASI) |
HBV保有:181症例 HBV排除:185症例 対照:184名 HBV陽性肝癌:473症例 HBV保有(慢性肝炎患者および無症候キャリア):516症例 (日本人) |
溝上 雅史 |
非制限公開 |
|
日本人原発性胆汁性肝硬変の発症・進展に関わる遺伝因子の網羅的遺伝子解析 |
v1:2016/10/05 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (Axiom ASI) |
PBC:487症例 対照:476名 (日本人) |
中村 稔 |
非制限公開 |
|
JGAS000120 |
日本人健常者におけるゲノム全域のSNP解析 |
v1:2017/09/26 v2:2017/10/03 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 健常者遺伝子型 |
Affymetrix (Axiom ASI/6.0) |
419名 (日本人) |
徳永 勝士 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000070 |
バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究(肺がん) |
v1:2016/10/28 |
NGS (CAGE-seq) |
転写開始点同定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
肺癌:97症例 (日本人) |
林崎 良英 |
制限(Type I) |
JGAS000108 |
胸腹部腫瘍の長期治療成績に関する分子生物学的研究 環境因子が関与する腫瘍のゲノム解析 |
v1:2017/10/16 v2:2018/09/25 |
アレイCGH NGS(WGS、Target Capture、Exome) |
配列決定 |
Illumina (MiSeq、HiSeq 4000/X Ten) |
悪性中皮腫患:72症例 (日本人、米国人) |
大村谷 昌樹 |
制限(Type I) |
JGAS000073 JGAS000107 |
生殖発生にかかわる細胞のエピゲノム解析基盤研究 |
v1:2017/09/25 v2:2017/12/26 v3:2018/06/26 |
NGS(WGBS、ChIP-seq、RNA-seq、small RNA-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 1500/2500) |
胎盤もしくは子宮の細胞、ヒト胎盤幹細胞:計39検体 (日本人) |
佐々木 裕之 (IHEC) |
制限(Type I) |
JGAS000077 JGAS000096 |
腫瘍細胞におけるTGF-βファミリーシグナルの網羅的解析 |
v1:2019/02/08 v2:2019/09/10 |
NGS (RNA-seq、WGS) |
発現 配列決定 |
Illumina (Genome Analyzer IIx) Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
脳腫瘍:2症例 (日本人) |
宮園 浩平 |
制限(Type I) |
JGAS000078 JGAS000079 JGAS000080 |
ヒト消化器ならびに泌尿器上皮細胞の 標準エピゲノム解析 (COCシリーズ) |
v1:2016/11/18 |
NGS (WGBS ChIP-seq RNA-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) |
大腸粘膜吸収上皮細胞:12種類 (日本人) |
金井 弥栄 (IHEC) |
制限(Type I) |
JGAS000095 JGAS000105 JGAS000113 JGAS000128 JGAS000215 JGAS000270 |
悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明 |
v1:2017/09/04 v2:2018/01/22 v3:2019/02/12 v4:2020/08/14 v5:2020/10/26 v6:2021/01/29 |
NGS (WGS、Exome、RNA-seq)、メチル化アレイ、SNP-chip |
配列決定 発現 メチル化 CNV |
Illumina (HiSeq 2000/2500、Infinium Human MethylationEPIC BeadChip、HumanOmni2.5-8 BeadChip) |
乳癌:68症例 肺腺癌:43+126症例 大腸癌:150症例 肝転移を有する大腸癌12症例、肝転移を有さない大腸癌16症例 デスモイド腫瘍:64症例 (日本人) |
間野 博行 |
制限(Type I) |
JGAS000092 |
大腸前がん病変および早期大腸がんにおける遺伝子解析および発がん機序の解明 |
v1:2018/07/30 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
大腸腺腫、大腸癌早期病変:計10症例 (日本人) |
三森 功士 |
制限(Type I) |
JGAS000090 JGAS000138 |
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析(小児T細胞性急性リンパ性白血病) |
v1:2017/05/25 v2:2019/11/18 |
NGS (RNA-seq) メチル化アレイ |
発現 メチル化 |
Illumina (HiSeq 2500、Infinium MethylationEPIC) |
小児T-ALL:123症例 (日本人) |
滝田 順子 |
制限(Type I) |
JGAS000094 |
骨髄不全症候群における血球の質に関する検討 |
v1:2018/05/25 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
第6染色体短腕の片親性ダイソミー陽性再生不良性貧血:5症例 (日本人) |
中尾 眞二 (ゲノム支援) |
制限(Type I) |
JGAS000085 |
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析 |
v1:2017/04/24 |
NGS (RNA-seq) SNP-chip |
eQTL 発現 ゲノムワイド 関連 |
Illumina (HiSeq 2500、Infinium OmniExpressExome BeadChips) |
健常者:105名 (日本人) |
山本 一彦 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000098 |
EBウイルス関連リンパ腫を発症した原発性免疫不全症候群の原因遺伝子探索に関する研究 |
v1:2018/05/11 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
原発性免疫不全症:2症例 (日本人) |
岩谷 靖雅 |
制限(Type I) |
JGAS000109 |
シークエンス解析によるがんゲノム研究:胆道がん |
v1:2018/02/27 v2:2019/06/21 |
NGS (WGS、Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500、NovaSeq 6000) |
胆道癌:98症例 (日本人) |
中川 英刀 |
制限(Type I) |
JGAS000099 JGAS000218 |
基底細胞母斑症候群患者からのinduced pluripotent stem (iPS)細胞の樹立および病態の解明、骨移植への臨床応用 |
v1:2017/10/02 v2:2020/06/01 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500/4000) |
基底細胞母斑症候群:4症例 (日本人) |
東 俊文 |
制限(Type I) |
JGAS000111 |
精神疾患発症にかかわる関連遺伝子の探索および解析 |
v1:2017/06/26 |
メチル化アレイ |
メチル化 |
Illumina (Human Methylation 450K BeadChip) |
パニック症:48症例 対照健常者:48名 (日本人) |
徳永 勝士 |
制限(Type I) |
JGAS000103 JGAS000141 JGAS000242 |
胃腫瘍のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明 |
v1:2017/07/31 v2:2019/05/31 v3:2021/02/19 |
NGS (RNA-seq、Amplicon-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2000、MiSeq) |
びまん性胃癌:30症例 胃癌:60+15症例 (日本人) |
石川 俊平 |
制限(Type I) |
JGAS000112 (JGA000122) |
ヒト胎盤幹細胞の樹立と細胞特性に関する基礎的研究 |
v1:2017/12/14 |
NGS(WGBS、ChIP-seq、RNA-seq、miRNA-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 1500/2500) |
ヒト胎盤幹細胞:2系統 (日本人) |
有馬 隆博 |
制限(Type I) |
JGAS000119 |
パーキンソン病の代謝産物バイオマーカー創出およびその分子標的機構に基づく創薬シーズ同定 |
v1:2020/04/24 |
NGS (CAGE-seq) |
転写開始点同定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
パーキンソン病:39症例、対照健常者:20名 (日本人) |
Piero Carninci |
制限(Type I) |
DRA007411 |
日本人由来B細胞株DNAのゲノムデータを用いた遺伝統計解析手法の研究 |
v1:2017/12/18 v2:2019/04/12 |
SNP-chip NGS (Target Capture) |
ゲノムワイド 関連 配列決定 |
Illumina (HumanCoreExome BeadChip、MiSeq) |
乾癬:282症例 対照:426名 細胞株:560検体 (日本人) |
岡田 随象 |
非制限公開 |
JGAS000121 DRA006296 |
動的遺伝子ネットワークの多次元構造解析による高精度な細胞分化制御技術の開発 |
v1:2020/05/15 |
NGS (RNA-seq) マイクロアレイ |
発現 |
Illumina (HiSeq 2000/2500) Agilent Technologies (SurePrint G3 Human GE v2 8x60K Microarray、SureScan G4900DA) |
SEES3にTFを導入して樹立したES細胞株(TF-hESC) (細胞株) |
洪 実 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000122 |
ヒト化マウス(humanized mouse) の作製と免疫学研究への応用 |
v1:2020/11/20 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 1500/2500) |
急性骨髄性白血病:118症例 (日本人) |
石川 文彦 |
制限(Type I) |
JGAS000125 |
神経変性疾患のエピジェネティクス解析 |
v1:2017/12/11 |
メチル化アレイ |
メチル化 |
Illumina (Human Methylation 450K BeadChip) |
アルツハイマー病:30症例 対照健常者:30名 (日本人) |
岩田 淳 |
制限(Type I) |
JGAS000124 |
バイオマーカー探索に資する網羅的遺伝子解析研究(子宮体がん) |
v1:2017/12/11 |
NGS (CAGE-seq) Sanger-seq |
転写開始点同定 配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) Thermo Fisher Scientific(ABI)3500 Genetic Analyzer |
子宮体癌:17症例 (日本人) |
林崎 良英 |
制限(Type I) |
JGAS000126 |
NASHの発症、進展を規定するメカニズム解析 |
v1:2019/01/31 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Illumina (Human610-Quad BeadChip、HumanCoreExome BeadChip、HumanOmni2.5-Quad BeadChip) |
NAFLD患者:902症例 対照健常者:7672名 (日本人) |
松田 文彦 |
制限(Type I) |
JGAS000221 DRA011183 DRA011184 DRA011185 |
消化器癌患者の末梢血液中における転移再発の予測因子候補に関する臨床的意義の確立 |
v1:2020/04/03 v2:2020/10/30 |
NGS (Exome、RNA-seq、Target Capture) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
大腸癌:10症例 (日本人) |
三森 功士 |
制限(Type I) 非制限公開 |
DRA006622 DRA007336 DRA008459 E-GEAD-311 |
市販ヒト初代細胞由来iPS 細胞のゲノム変異解析 |
v1:2020/01/14 |
NGS (WGS) SNP-chip |
配列決定 ゲノムワイド |
Illumina (HiSeq X Ten、Infinium Omni2.5-8 v1.4 BeadChip) |
市販のヒト培養細胞、およびそれから誘導したiPS細胞株:計27検体 (細胞株) |
荒木 良子 |
非制限公開 |
JGAS000129 |
ヒト上皮成長因子受容体(EGFR)遺伝子変異をもつ肺癌家系における肺癌発癌関連遺伝子同定に関する研究 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
EGFR遺伝子変異をもつ肺癌:3症例(1家系) (日本人) |
菊地 利明 |
制限(Type I) |
JGAS000127 |
制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究 |
v1:2018/11/05 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Thermo Fisher Scientific (Ion S5) |
クローン病:3症例 大腸癌:4症例(非腫瘍組織) (日本人) |
坂口 志文 |
制限(Type I) |
小児ネフローゼ症候群の疾患感受性遺伝子及び薬剤感受性遺伝子同定研究 |
v1:2018/04/27 v2:2020/09/01 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (Japonica Array v1/v2) |
小児ネフローゼ症候群:224+3,206症例 対照健常者:419+987名 (日本人) |
飯島 一誠 |
非制限公開 |
|
JGAS000130 |
マルチオーミクス解析を用いたがん患者評価に基づく個別化治療と新技術開発に関する研究ープロジェクトHOPE (High-tech Omics-based Patients Evaluation) for Cancer Therapyー |
v1:2020/04/14 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
POLE変異および高変異症例の癌:91症例 (日本人) |
山口 建 |
制限(Type I) |
JGAS000153 |
慢性好酸球性炎症疾患の網羅的遺伝子解析と網羅的蛋白質解析に関する研究 |
v1:2018/10/29 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2000) |
慢性副鼻腔炎:6症例 (日本人) |
藤枝 重治 |
制限(Type I) |
JGAS000131 |
神経疾患患者からのiPS細胞の樹立とそれを用いた疾患解析に関する研究 |
v1:2018/04/06 |
NGS (ChIP-seq) |
ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq 2500) |
CHARGE症候群:2症例 (日本人) |
岡野 栄之 |
制限(Type I) |
JGAS000150 |
POEMS症候群の骨髄細胞における遺伝子異常の網羅的解析 造血器腫瘍と骨髄ニッチ細胞の遺伝子異常解析による分子病態の解明と新規治療薬開発の基盤構築 |
v1:2019/01/18 |
NGS (Exome、Target Capture、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 1500/2500、MiSeq) |
POEMS症候群:20症例 多発性骨髄腫:4症例 MGUS:5症例 (日本人) |
堺田 恵美子 |
制限(Type I) |
JGAS000132 |
発達障害のエピゲノム解析 |
v1:2018/11/20 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
Williams症候群:6症例 対照健常者:8名 (日本人) |
木村 亮 |
制限(Type I) |
JGAS000137 |
ベトナムにおけるダイオキシン関連疾患のゲノムシークエンス解析 |
v1:2018/09/07 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
ダイオキシン暴露者(退役軍人)とその妻と知的障害を持つ子の9トリオ(計27名) (ベトナム人) |
中川 英刀 |
制限(Type I) |
JGAS000086 |
胃がんの転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
胃癌:75症例 (日本人) |
山口 俊晴 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
JGAS000087 |
Bリンパ腫の転移/再発に特徴的な遺伝子変異の同定 |
v1:2018/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
Bリンパ腫:60症例 (日本人) |
山口 俊晴 (P-DIRECT) |
制限(Type I) |
B型肝炎に関する統合的臨床ゲノムデータベースの構築を目指す研究 |
v1:2018/05/22 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (Axiom ASI) |
B型肝炎ワクチン接種者:1,193名 (日本人) |
溝上 雅史 |
非制限公開 |
|
JGAS000144 |
1型糖尿病関連遺伝子群の多施設共同研究 |
v1:2018/12/21 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
1型糖尿病:32症例 (日本人) |
池上 博司 |
制限(Type I) |
JGAS000134 |
固形腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2020/07/31 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (Hiseq 2500/4000) |
肝硬変:10症例 肝癌:4症例 (日本人) |
高井 淳 |
制限(Type I) |
JGAS000136 |
疾患特異的iPS細胞を用いた創薬・疾患研究 |
v1:2018/07/10 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 1500) |
RALD患者:1症例 (日本人) |
大津 真 |
制限(Type I) |
JGAS000158 |
microRNA/mRNA網羅的発現解析及び全エクソンシークエンス解析に基づく直腸癌術前治療効果予測法の開発 |
v1:2019/11/19 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
術前放射線化学療法施行直腸癌:74症例 (日本人) |
秋吉 高志 |
制限(Type I) |
JGAS000135 |
制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究 |
v1:2019/05/09 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Thermo Fisher Scientific (Ion S5) |
頭頸部癌:4症例 (日本人) |
坂口 志文 |
制限(Type I) |
JGAS000147 |
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析(ダウン症候群患者におけるB前駆細胞性急性リンパ性白血病) |
v1:2020/01/10 |
NGS (RNA-seq) メチル化アレイ、 SNP-chip |
発現 メチル化 ゲノムワイド |
Illumina (HiSeq 2000/2500、Infinium MethylationEPIC BeadChip、Infinium HumanMethylation450 BeadChip) Affymetrix (GeneChip Human Mapping 250K Nsp、CytoScan HD) |
ダウン症候群患者のB前駆細胞性急性リンパ性白血病:43症例 (日本人) |
滝田 順子 |
制限(Type I) |
JGAS000222 |
消化器癌患者の末梢血液中における転移再発の予測因子候補に関する臨床的意義の確立 |
v1:2020/04/03 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
大腸癌:10症例 (日本人) |
三森 功士 |
制限(Type I) |
DRA007187 |
先天性インプリント異常症の診断と生殖医療の安全性評価 |
v1:2019/02/19 |
NGS (RRBS) |
メチル化 |
Illumina (HiSeq 2500) |
生殖補助医療を受けたSRS患者:5症例 生殖補助医療を受けていないSRS患者:5症例 対照健常児:10名 (日本人) |
有馬 隆博 |
非制限公開 |
JGAS000145 |
制御性T細胞特異的エピゲノム誘導による免疫制御の研究 |
v1:2020/05/25 |
NGS (RNA-seq、ChIP-seq、PBAT-seq、ATAC-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 クロマチン構造 |
Thermo Fisher Scientific (Ion S5) Illumina (HiSeq 2500、NovaSeq 6000) |
健常人:4名 (日本人) |
坂口 志文 |
制限(Type I) |
JGAS000149 |
泌尿器科腫瘍組織での遺伝子異常と発現解析 |
v1:2019/06/20 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (Genome Analyzer IIx) |
腎癌:67症例 (日本人) |
湯浅 健 |
制限(Type I) |
JGAS000182 |
ゲノム・プロテオーム解析に基づく骨軟部腫瘍の分子病態把握とその臨床応用を目指す多施設共同研究 |
v1:2019/09/20 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
脱分化型脂肪肉腫:37症例 (日本人) |
市川 仁 |
制限(Type I) |
JGAS000177 |
希少腫瘍の発症・予後に関する遺伝子の網羅的解析研究 |
v1:2019/09/20 |
NGS (Exome、RNA-seq、Target Capture) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500、MiSeq) |
脱分化型脂肪肉腫:28症例 腱鞘巨細胞種:36症例 (日本人) |
松田 浩一 |
制限(Type I) |
JGAS000164 |
がんのクリニカルシークエンスと付随研究としての網羅的ゲノム・エピゲノム解析 |
v1:2019/08/19 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (NextSeq) |
癌:183症例 (日本人) |
宮園 浩平 |
制限(Type I) |
JGAS000151 |
シークエンス解析によるがんゲノム研究:肝臓がん |
v1:2018/10/22 v2:2019/06/21 |
NGS (WGS、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2000、Genome Analyzer IIx、NovaSeq 6000) |
肝臓癌:263症例 (日本人) |
中川 英刀 |
制限(Type I) |
JGAS000155 |
シークエンス解析によるがんゲノム研究:食道がん |
v1:2019/05/28 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000/2500/X Five) |
食道癌:20症例 (日本人) |
中川 英刀 |
制限(Type I) |
精神・神経疾患治療薬及びがん治療薬におけるファーマコゲノミクス研究 |
v1:2018/12/14 v2:2021/02/09 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
精神・神経疾患及び癌:計990症例 (日本人) |
莚田 泰誠 |
非制限公開 |
|
JGAS000160 |
東北メディカル・メガバンク事業地域住民コホート調査 |
v1:2018/12/14 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Illumina (Infinium OmniExpressExome-8) |
住民コホートに参加した9,187名 (日本人) |
長﨑 正朗 |
制限(Type I) |
JGAS000162 |
家族性骨髄異形成症候群の遺伝子解析研究 |
v1:2019/05/07 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
家族性骨髄異形成症候群:2症例(1家系) (日本人) |
古屋 淳史 |
制限(Type I) |
炎症性腸疾患患者におけるチオプリン関連副作用とNUDT15遺伝子多型との相関性に関する多施設共同研究(MENDEL Study) |
v1:2019/07/30 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Affymetrix (Japonica Array v1) |
炎症性腸疾患:1221症例 (日本人) |
角田 洋一 |
非制限公開 |
|
痛風・高尿酸血症及び尿酸関連疾患の病態解明に関する研究 |
v1:2019/07/23 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Illumina (HumanOmniExpressExome-8、660W-Quad、Omni2.5-8、OmniExpress-12、OmniExpress-24、HumanOmniExpressExome、HumanOmniExpress、HumanExome BeadChip) |
日本人コホート(J-MICC study、KING study、BBJ):計121,745名 (日本人) |
松尾 洋孝 |
非制限公開 |
|
JGAS000169 |
悪性腫瘍のゲノム・エピゲノム解析による病態解明 |
v1:2019/11/08 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
子宮腺筋症:51症例 (日本人) |
河津 正人 |
制限(Type I) |
JGAS000178 |
脳脊髄腫瘍のバイオマーカーの探索と標的治療開発に向けた遺伝子解析及びヒト由来脳脊髄腫瘍細胞株を用いた前臨床研究 |
v1:2019/06/01 v2:2020/07/17 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
中枢神経原発悪性リンパ腫:9症例 (日本人) |
山本 哲哉 |
制限(Type I) |
JGAS000171 |
胎児期に始まる子どもの健康と発達に関する調査 |
v1:2019/04/23 |
NGS (RRBS) |
メチル化 |
Illumina (NextSeq) |
臍帯組織(正常出産):30検体 (日本人) |
森 千里 |
制限(Type I) |
JGAS000173 |
日本人ゲノム構造変異データベースの作成 |
v1:2020/10/06 v2:2020/11/27 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
PacBio (Sequel) 10x Genomics (Chromium Controller) |
日本人由来B細胞株・DNAバンクから分譲されたDNAサンプル:10+11検体 |
森下 真一 |
制限(Type I) |
JGAS000174 |
治療抵抗性・再発予測バイオマーカーならびに新規分子標的治療法開発のための婦人科腫瘍検体の収集、保管ならびにゲノム・エピゲノム解析 |
v1:2019/10/02 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
子宮類内膜腺癌:69症例 (日本人) |
竹島 信宏 |
制限(Type I) |
JGAS000172 |
子宮及び卵巣がん肉腫におけるドライバー変異の体系的探索 |
v1:2019/10/02 |
NGS (Exome、Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
子宮癌肉腫:92症例 卵巣癌肉腫:17症例 (日本人) |
森 誠一 |
制限(Type I) |
JGAS000197 |
脳腫瘍の悪性化に関与する遺伝子の解析 |
v1:2020/04/27 |
NGS (WGBS、RNA-seq、ChIP-seq) |
発現 メチル化 ヒストン修飾 |
Illumina (HiSeq X Ten、NovaSeq 6000) |
悪性神経膠腫:14症例 (日本人) |
伊藤 隆司 |
制限(Type I) |
JGAS000186 DRA009794 |
薬剤関連顎骨壊死における口腔内微生物叢メタゲノム解析 |
v1:2020/04/03 |
メタゲノム |
メタゲノム |
Nanopore (PromethION) Illumina (HiSeq) |
健常者:4名 (日本人) |
矢原 耕史 (ゲノム支援) |
制限(Type I) 非制限公開 |
副腎皮質におけるアルドステロン産生の老化の解明 |
v1:2019/09/25 |
病理スライドガラス画像 |
病理画像 |
Dako (Autostainer Link 48) |
病理解剖を施行された50歳以上の症例:85症例 (日本人) |
西本 紘嗣郎 |
非制限公開 |
|
JGAS000180 DRA008482 |
全ゲノムシークエンスデータの解析による変異と遺伝的多様性の包括的解析 |
v1:2019/06/20 v2:2020/05/12 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Nanopore (MinION) Illumina (HiSeq 2000、Genome Analyzer IIx) |
肝臓癌(正常細胞):174症例 HapMap:1検体 (日本人) |
藤本 明洋 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000239 |
日本人全ゲノムデータベースの構築 |
v1:2020/09/01 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500、NovaSeq 6000) |
一般住民:4,566名 (日本人) |
山本 雅之 |
制限(Type II) |
JGAS000194 |
消化器癌のゲノム・遺伝子解析とその臨床病理学的意義の解明 |
v1:2020/05/12 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
肝癌:243症例 (日本人) |
油谷 浩幸 |
制限(Type I) |
JGAS000179 |
胃がん細胞株のゲノム解析による治療標的同定 |
v1:2019/06/28 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
胃癌細胞株:2検体 (細胞株) |
間野 博行 |
制限(Type I) |
DRA008575 |
個々のがんの遺伝子変異に基づく固有抗原の同定と腫瘍内微小環境の解析に基づく免疫制御法を組み合わせた個別化がんワクチン治療の開発 |
v1:2020/06/05 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 1500/4000) |
膵癌:17症例 (日本人) |
垣見 和宏 |
非制限公開 |
JGAS000189 |
分子プロファイリングによる薬剤抵抗性機構の研究 |
v1:2020/05/11 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (MiSeq) |
肺癌:2症例 (日本人) |
片山 量平 |
制限(Type I) |
自殺者血液および死後脳標本を用いた自殺に関連した生物学的マーカーの同定と自殺予防への応用に関する研究 |
v1:2019/12/20 |
SNP-chip |
ゲノムワイド 関連 |
Illumina (HumanOmniExpress-24 BeadChip、HumanOmniExpressExome-8 BeadChip) |
自殺者:746名 非自殺者:14,049名 (日本人) |
菱本 明豊 |
非制限公開 |
|
JGAS000205 JGAS000260 |
多層的オミクス解析による疾患病態の解明 |
v1:2019/11/15 v2:2020/11/27 |
メタゲノム SNP-chip |
メタゲノム ゲノムワイド関連 |
Illumina (HiSeq 3000、Infinium Asian Screening Array) |
日本人集団:95+103名 肺胞蛋白症:198症例 対照者:395名 (日本人) |
岡田 随象 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000198 |
次世代シーケンサーを用いた泌尿器悪性腫瘍の治療標的分子の同定 |
v1:2020/06/29 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
前立腺癌:25症例 (日本人) |
藤村 哲也 |
制限(Type I) |
JGAS000199 JGAS000237 JGAS000256 |
ヒト腫瘍試料の収集・分譲とゲノム情報を利用した研究 既存試料の分譲とゲノム情報を利用した研究 消化器慢性炎症性疾患における遺伝子変異の検索 |
v1:2019/12/20 v2:2020/10/06 v3:2020/11/20 |
NGS (Exome、WGS、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500/4000、NovaSeq 6000) |
潰瘍性大腸炎:29症例 腫瘍を併発する潰瘍性大腸炎:26症例 下部消化管内視鏡検査を受けた患者(対照者):16名 腫瘍性疾患:23+1症例 (日本人) |
佐藤 俊朗 |
制限(Type I) |
JGAS000206 |
造血器腫瘍における臨床ゲノム情報統合データベースの構築に関する研究 |
v1:2020/06/01 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
多発性骨髄腫:154症例 (日本人) |
堀部 敬三 |
制限(Type I) |
JGAS000207 |
妊娠関連疾患の胎盤栄養膜細胞株の樹立と細胞特性に関する研究 |
v1:2019/11/26 |
NGS (WGBS、RNA-seq) |
発現 メチル化 |
Illumina (HiSeq 1500/2500) |
全胞状奇胎:3症例 (日本人) |
有馬 隆博 |
制限(Type I) |
ヒト免疫細胞における遺伝子多型と遺伝子発現の関連解析 |
v1:2020/01/06 |
NGS (RNA-seq、ChIP-seq、Hi-C) eQTL |
発現 ヒストン修飾 クロマチン構造 eQTL |
Illumina (HiSeq 2500、HiSeq series、Infinium OmniExpressExome BeadChips) |
関節リウマチ:30症例 変形性関節症:30症例 (日本人) |
藤尾 圭志 |
非制限公開 |
|
JGAS000214 |
頭頚部悪性腫瘍に対する網羅的遺伝子解析およびデータベースの構築 |
v1:2020/01/20 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq X Ten) |
外耳道癌:10症例 (日本人) |
中川 尚志 |
制限(Type I) |
関節リウマチ治療におけるメトトレキサートの効果と副作用予測のための多施設研究 |
v1:2019/12/13 |
SNP-chip ダイレクトシークエンス |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (GeneChip® Scanner 3000 7G) Applied Biosystems (Veriti 96-Well Thermal Cycler and 3730XL DNA Analyzer) |
関節リウマチ:166症例 (日本人) |
熊谷 俊一 |
非制限公開 |
|
JGAS000211 |
造血器腫瘍における遺伝子異常の網羅的解析 |
v1:2020/04/06 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (NextSeq 500) |
急性骨髄性白血病と縦隔胚細胞腫瘍の合併症例:1症例 (日本人) |
下田 和哉 |
制限(Type I) |
JGAS000220 |
ヒト免疫系の機能ゲノム学による統合的理解とこれを用いた免疫疾患の発症予防のためのインターベンション戦略の構築 |
v1:2020/10/09 |
NGS (RNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
全身性強皮症:21症例 健常者:13名 (日本人) |
藤尾 圭志 |
制限(Type I) |
JGAS000216 JGAS000244 |
新規免疫療法や併用療法開発を目指した固形癌患者の免疫状態の解析 |
v1:2020/02/07 v2:2020/09/25 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
肺腺癌:17症例 胃癌:26症例 肺癌:9症例 悪性黒色腫:5症例 (日本人) |
西川 博嘉 |
制限(Type I) |
JGAS000217 |
大腸ポリープから癌への進展を予測する遺伝子変化の同定 |
v1:2020/03/02 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Torrent) |
大腸鋸歯状病変(鋸歯状ポリープ):50症例 (日本人) |
澤田 武 |
制限(Type I) |
E-GEAD-344 |
全身性強皮症患者の遺伝子発現解析 |
v1:2020/10/09 |
NGS (scRNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq) |
全身性強皮症:3症例 (日本人) |
藤尾 圭志 |
非制限公開 |
JGAS000223 |
採血後の試験管保存状態が試験管内の化合物濃度に与える影響の研究 |
v1:2020/06/02 |
LC-MS/MS |
質量分析 |
Sciex (TripleTOF 5600) |
健常人:3名 (日本人) |
大槻 純男 (AMED疾患代謝) |
制限(Type I) |
JGAS000224 |
NGS技術を駆使した遺伝学的解析による家族性乳がんの原因遺伝子同定と標準化医療構築 |
v1:2020/03/13 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
乳癌:115症例 (日本人) |
大野 真司 |
制限(Type I) |
JGAS000232 |
血液がんにおける遺伝子変異の解析 |
v1:2020/09/01 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
多発性骨髄腫:7症例 (日本人) |
照井 康仁 |
制限(Type I) |
JGAS000226 |
HTLV-1関連脊髄症(HAM)におけるゲノム異常及びエピゲノム異常の解析 |
v1:2020/05/08 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500/3000) |
HTLV-1関連脊髄症(HAM):21症例 (日本人) |
山岸 誠 |
制限(Type I) |
JGAS000230 |
老化・神経疾患における分子マーカーの探索と分子基盤の解明 |
v1:2020/05/15 |
NGS (scRNA-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
スーパーセンチナリアン(110歳以上):7名 家族:2名 血縁関係のない対照群:2名 (日本人) |
Piero Carninci |
制限(Type I) |
JGAS000231 |
胃癌由来循環腫瘍DNAモニタリングによる転移・再発の検証 |
v1:2020/06/01 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
胃癌:10症例 (日本人) |
西塚 哲 |
制限(Type I) |
JGAS000245 |
肺がんの複雑な遺伝子変異を利用した腫瘍浸潤リンパ球療法の開発を目指した基礎的検討 |
v1:2020/12/14 |
NGS (Exome、RNA-seq) |
配列決定 発現 |
Illumina (HiSeq 2500) Nanopore (MinION) |
非小細胞肺癌:7症例 (日本人) |
中面 哲也 |
制限(Type I) |
JGAS000240 |
オーダーメイド医療開発プロジェクト |
v1:2020/07/28 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2500) |
BBJ:10名 (日本人) |
桃沢 幸秀 |
制限(Type I) |
JGAS000241 |
がん、感染症、難病、生活習慣病等に関する遺伝子とタンパク質などの網羅的解析 |
v1:2020/07/27 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Proton) |
膀胱がん:19症例 (日本人) |
弘津 陽介 |
制限(Type I) |
JGAS000258 |
中枢神経原発悪性リンパ腫の全ゲノムシーケンス解析 |
v1:2020/10/30 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Thermo Fisher Scientific (Ion Torrent) |
中枢神経原発悪性リンパ腫:28症例 (日本人) |
山中 龍也 |
制限(Type I) |
JGAS000243 |
変異遺伝子のモニタリングによる大腸癌術後の微少転移及び再発の新たな評価法の検証 |
v1:2021/01/05 |
NGS (Target Capture) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 2000) |
大腸癌:12症例 (日本人) |
西塚 哲 |
制限(Type I) |
JGAS000253 |
ヒト化マウス(humanized mouse) の作製と免疫学研究への応用/ヒト・造血免疫系由来iPS細胞を用いた疾患と治療モデルの構築 |
v1:2020/11/20 |
NGS (RNA-seq、CAGE-seq) |
発現 |
Illumina (HiSeq 2500) |
臍帯血:24名 急性骨髄性白血病:116症例 (日本人) |
石川 文彦 |
制限(Type I) |
JGAS000249 DRA010773 |
がん患者免疫状態を反映するがん遺伝子変異の探索 |
v1:2021/01/04 |
NGS (Exome) |
配列決定 |
Illumina (HiSeq 1500) |
悪性黒色腫:3症例 (日本人) |
岩田 卓 |
制限(Type I) 非制限公開 |
JGAS000259 |
高精度長鎖解読による日本人基準ゲノム配列策定 |
v1:2020/10/30 v2:2020/11/06 |
NGS (WGS) |
配列決定 |
PacBio(RS II) Bionano(Irys、Saphyr) Illumina(HiSeq 2500) |
日本人健常男性:3名 (日本人) |
山本 雅之 |
非制限公開 制限(Type II) |
JGAS000248 |
硬組織・結合組織関連疾患患者由来iPS細胞を用いた病態解明と治療法開発 |
v1:2020/09/01 |
NGS (CAGE-seq) |
転写開始点同定 |
Illumina (NextSeq 500) |
鎖骨頭蓋骨異形成症:3症例 (日本人) |
東 俊文 |
制限(Type I) |
原発性胆汁性胆管炎の病態解明のためのゲノムワイド関連解析 ― 1,000 症例の追加解析 ― |
v1:2021/01/08 v2:2021/01/19 |
SNP-chip |
領域内遺伝率推定 ゲノムワイド関連 |
Affymetrix (Axiom Genome-Wide ASI 1 Array、Japonica Array v1) |
原発性胆汁性胆管炎:1,953症例 健常対照者:3,690名 (日本人) |
中村 稔 |
非制限公開 |
・ DDBJ Sequence Read Arichive (DRA)サイトにおいて、the European Sequence Read Archive (ERA)およびthe Sequence Read Archive (SRA)に登録済みデータを検索できます。
・ Database Center for Life Science (DBCLS) SRAサイトからの検索も可能です。