NBDC Research ID: hum0023.v1

 

研究内容の概要

目的: 高血圧症の遺伝因子の解明

方法: Illumina HiSeq 2000を使用したExome解析

対象: III度以上の本態性高血圧患者30症例

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000016 NGS(Exome) 制限公開(Type I) 2015/01/28

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分子データ

JGAS00000000016

対象 III度以上の本態性高血圧患者30症例
規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq 2000]
ライブラリソース 末梢血から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) SureSelect Human All Exon 50 Mb Kit (Agilent社)
断片化の方法 超音波断片化(Covaris社、S220)
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 100 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000016
総データ量 405 GB (634 files)
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NBDC policy

※当該データは、文部科学省科学研究費新学術領域研究(研究領域提案型)『生命科学系3分野支援活動』に採択された「ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援」(「ゲノム支援」)による支援を受けました。

 

提供者情報

研究代表者: 三木 哲郎

所 属 機 関: 愛媛大学大学院医学系研究科 老年・神経・総合診療内科学

プロジェクト/研究グループ名: ミレニアム・ゲノムプロジェクト

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
科学研究費助成事業 基盤研究(B) 期縦断大規模ゲノム疫学研究による生活習慣病発症の遺伝因子に関するエビデンス構築 21390099

 

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タイトルDOIデータID
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