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NBDC Research ID: hum0007.v1

 

研究内容の概要

目的: Th1細胞およびTh17細胞における遺伝子発現を解析することで、自己免疫疾患の原因解明や治療方法の確立を目指す

方法: AppliedBioSystem SoLiDを使用したRNA-Seq解析

対象: 健常者1例の末梢血から単離したナイーブT細胞、Th1細胞、inactive-Th17, active-Th17

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000005 NGS (RNA-seq) 制限公開(Type I) 2015/02/12

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分子データ

JGAS00000000005

対象 健常者1例(ナイーブT細胞、Th1細胞、inactive-Th17, active-Th17)
規模 RNA-seq
対象領域(Target Captureの場合)

-

Platform

Applied BioSystem [5500 Genetic Analyzer]

ライブラリソース

ヒト末梢血リンパ球から調整した免疫細胞(ナイーブCD4+ T細胞、Th1細胞、活性化前CD161+Th17 細胞、活性化後CD161+Th17細胞)からRNAを抽出

Th17細胞の活性化については、IL-1βとIL-23を用いたTh17誘導刺激を実施

検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) Applied BioSystem [SoLiD SAGE Kit]
断片化の方法 -
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 35 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000005
総データ量 12.16 GB
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NBDC policy

 

提供者情報

研究代表者: 巌本三壽

所 属 機 関: 昭和大学医学部 生化学教室

プロジェクト/研究グループ名: ヒトTh17細胞サブセットに関する研究

URL: http://www10.showa-u.ac.jp/~biochem/Biochem/Biochem_top.html

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号

該当なし

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 TNF-alpha drives human CD14+ monocytes to differentiate into CD70+ dendritic cells evoking Th1 and Th17 responses. doi:10.4049/jimmunol.179.3.1449 JGAD00000000005
2      

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関利用データID利用期間
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