NBDC Research ID: hum0070.v1

 

研究内容の概要

目的: Birt-Hogg-Dube 症候群に発症した腎癌における遺伝子変異を明らかにする。

方法: 全エキソン解析

対象: Birt-Hogg-Dube 症候群15症例

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000115 NGS(Exome) 制限公開(Type I) 2018/05/11

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分子データ

JGAS00000000115

対象

バート・ホッグ・デュベ症候群:15症例

 腎臓がん組織29検体、及び正常腎組織15検体

規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq 2000]
ライブラリソース 腎臓がん組織及び正常腎組織から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) Agilent SureSelect v.5 + lncRNA kit
断片化の方法 超音波断片化(Covaris S1)
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 100 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000125
総データ量 485 GB(bam [ref:hg19])
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提供者情報

研究代表者: 矢尾 正祐

所 属 機 関: 横浜市立大学大学院医学研究科・泌尿器科学

プロジェクト/研究グループ名:-

URL: http://www-user.yokohama-cu.ac.jp/~urology/wp/

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム(P-DIRECT) バート・ホッグ・デュベ症候群の分子病態解明と新規の診断マーカーおよび治療標的分子の探索研究 -

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 BHD-associated kidney cancer exhibits unique molecular characteristics and a wide variety of variants in chromatin remodeling genes (in press) JGAD00000000125
2

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関利用データID利用期間
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