NBDC Research ID: hum0067.v1

 

研究内容の概要

目的: 卵巣明細胞腺癌に対する新規バイオマーカーの検索と化学療法感受性に関する検討

方法: Illumina HiSeq 2000を使用したExome解析

対象: 卵巣明細胞腺癌55症例の腫瘍組織と正常組織の合計110検体

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000076 NGS(Exome) 制限公開(Type I) 2017/05/18

※リリース情報はこちら

※制限公開データの利用にあたっては、利用申請が必要です。申請方法はこちら

 

分子データ

JGAS00000000076

対象

卵巣明細胞腺癌:55症例

腫瘍組織および正常組織(計:110検体)

規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq 2000]
ライブラリソース 腫瘍組織もしくは正常組織(末梢血または間質組織)から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) SureSelect Custom Kit (SureSelect Human All Exon V5 + lincRNA)
断片化の方法 超音波断片化
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 100 bp x 2
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000076
総データ量 2 TB(fastq)
コメント(利用にあたっての制限事項) NBDC policyおよびP-DIRECT policy

 

提供者情報

研究代表者: 杉山 徹

所 属 機 関: 岩手医科大学 医学部 産婦人科学講座

プロジェクト/研究グループ名: http://p-direct.jfcr.or.jp/program/group02/team01.html

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
文部科学省 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム 卵巣がんにおける化学療法効果規定因子の探索 -

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 -    

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関利用データID利用期間
Go to top