NBDC Research ID: hum0039.v1

 

研究内容の概要

目的: 消化管間質腫瘍のチロシンキナーゼ阻害剤に対する獲得耐性機構の解明

方法: 腫瘍のエキソーム解析

対象: イマチニブに対して病理学的に耐性と診断された消化管間質腫瘍症例

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000039 NGS(Exome) 制限公開(Type I) 2016/12/27

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分子データ

JGAS00000000039

対象

イマチニブに対して病理学的に耐性と診断された

消化管間質腫瘍(原発腫瘍、体制腫瘍):4症例

規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [HiSeq1500]
ライブラリソース 切除腫瘍検体から抽出したgDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) SureSelect Human All Exon V5+UTRs
断片化の方法 超音波断片化(Covaris社)
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 101 bp
Japanese Genotype-phenotype Archive Data set ID JGAD00000000039
総データ量 202 GB(fastq)
コメント(利用にあたっての制限事項) JGAP00000000005

 

提供者情報

研究代表者: 高橋 剛

所 属 機 関: 大阪大学大学院 医学系研究科 外科学講座 消化器外科学

プロジェクト/研究グループ名:-

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
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