hum0006 リリース情報

Research ID公開日内容
hum0006.v4 2019/02/13 NGS (Exome、RNA-seq)、Methylation array
hum0006.v3 2017/09/01 NGS (Exome、RNA-seq)、Methylation array
hum0006.v2 2017/06/05 NGS (Exome、RNA-seq)、Methylation array
hum0006.v1 2014/01/31 NGS (Exome)

 

hum0006.v4

このバージョンでは、グリオーマ94症例(114検体)を対象とした以下の解析結果を追加した(JGAS00000000146)。

・ Exome(JGAD00000000215、JGAD00000000218): グリオーマ:12症例(腫瘍組織:25検体、非腫瘍組織:12検体)

    腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

・ RNA-seq(JGAD00000000216、JGAD00000000219): グリオーマ:23症例(31検体)

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

・ Methylation array(JGAD00000000217): グリオーマ:93症例(113検体)

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

 

hum0006.v3

このバージョンでは、グリオーマ(小脳17症例、視床14症例、大脳8症例)を対象とした以下の解析結果を追加した(JGAS00000000106)。

・ Exome: 小脳グリオーマ:17症例(34検体)

    腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

・ RNA-seq: 小脳グリオーマ17症例(17検体)および大脳グリオーマ8症例(8検体)

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

・ Methylation array: 小脳グリオーマ17症例(17検体)および視床グリオーマ14症例(14検体)

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

 

hum0006.v2

このバージョンでは、オリゴデンドログリオーマ16症例を対象とした以下の解析結果をJGAS00000000004に追加した。

・ Exome: 48検体

    腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを対象としてSureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

・ RNA-seq: 27検体

    腫瘍組織から抽出したRNAを対象としてTruSeq Stranded Total RNA Library Prep KitによるRNAライブラリ作製後、Illumina社HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)

・ Methylation array: 30検体

    腫瘍組織から抽出したDNAを対象としてIllumina社HumanMethylation 450 BeadChipにてメチル化解析を行った。

 

hum0006.v1

このバージョンでは、アストロサイトーマ6症例の初発時・再発時の腫瘍組織および末梢血(非腫瘍組織)から抽出したDNAを用いたExome解析の結果をbamファイルにて提供する。SureSelect Human All Exon v.4を用いてExon領域にしぼり、Illumina 社 HiSeq 2000にて平均長100塩基を解読した(Paired-end)。

 

 

Note: