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NBDC Research ID: hum0004.v1

研究内容の概要

目的: アジア人に発症頻度の高いEGFR変異陽性肺腺癌の網羅的遺伝子変異プロファイルを明らかにする

方法: 全エクソンシークエンシング(illumina [Genome Analyzer IIx])

対象: 手術切除された97例の肺癌部及び正常部組織(非癌部)から抽出したゲノムDNA

 

データID内容制限公開日
JGAS00000000001 NGS (Exome) 制限公開(Type I) 2014/07/11

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分子データ

JGAS00000000001

対象 97例の肺癌部及び正常部(非癌部)組織
規模 Exome
対象領域(Target Captureの場合) -
Platform Illumina [Genome Analyzer IIx]
ライブラリソース 肺癌部および非癌部組織から抽出したDNA
検体情報(購入の場合) -
ライブラリ作製方法(キット名) SureSelect Target Enrichment System
断片化の方法 超音波断片化(Covaris社)
ライブラリ構築方法 Paired-end
リード長(除:バーコード、アダプタ、プライマー、リンカー) 76 bp x 2
Japan Genotype-Phenotype Archive Data Set ID JGAD00000000001
総データ量
コメント(利用にあたっての制限事項)

NBDC policy

データ使用の範囲を肺癌研究に限定する

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提供者情報

研究代表者: 後藤功一

所 属 機 関: 国立がん研究センター東病院 呼吸器内科

プロジェクト/研究グループ名: 国立がん研究センター 早期・探索臨床研究センター トランスレーショナルリサーチ分野

URL: http://epoc.ncc.go.jp/about/staff/tsuchihara.php

科研費/助成金(Research Project Number):

科研費・助成金名タイトル研究課題番号
文部科学省科学研究費 基盤研究(B) 肺腺癌ゲノム解析に基づく治療標的キナーゼの探索 24300345

 

関連論文

タイトルDOIデータID
1 Identification and characterization of cancer mutations in Japanese lung adenocarcinoma without sequencing of normal tissue counterparts. doi: 10.1371/journal.pone.0073484. eCollection 2013. JGAD00000000001
2      

 

制限公開データの利用者一覧

研究代表者所属機関利用データID利用期間
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